Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVI7

PPP1R1C, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1C, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1CQ8WVI7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R1CQ8WVI7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R1CQ8WVI7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R1CQ8WVI7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R1CQ8WVI7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R1CQ8WVI7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R1CQ8WVI7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R1CQ8WVI7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R1CQ8WVI7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R1CQ8WVI7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R1CQ8WVI7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1R1CQ8WVI7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1R1CQ8WVI7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1R1CQ8WVI7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1R1CQ8WVI7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1R1CQ8WVI7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1R1CQ8WVI7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPP1R1CQ8WVI7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPP1R1CQ8WVI7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R1CQ8WVI7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R1CQ8WVI7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R1CQ8WVI7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R1CQ8WVI7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R1CQ8WVI7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R1CQ8WVI7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R1CQ8WVI7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R1CQ8WVI7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R1CQ8WVI7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R1CQ8WVI7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R1CQ8WVI7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R1CQ8WVI7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R1CQ8WVI7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R1CQ8WVI7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R1CQ8WVI7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R1CQ8WVI7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R1CQ8WVI7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R1CQ8WVI7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R1CQ8WVI7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R1CQ8WVI7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R1CQ8WVI7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R1CQ8WVI7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R1CQ8WVI7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R1CQ8WVI7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R1CQ8WVI7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R1CQ8WVI7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R1CQ8WVI7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1R1CQ8WVI7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1R1CQ8WVI7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1R1CQ8WVI7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R1CQ8WVI7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R1CQ8WVI7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R1CQ8WVI7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R1CQ8WVI7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R1CQ8WVI7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R1CQ8WVI7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R1CQ8WVI7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R1CQ8WVI7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R1CQ8WVI7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R1CQ8WVI7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R1CQ8WVI7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R1CQ8WVI7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1R1CQ8WVI7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1R1CQ8WVI7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1R1CQ8WVI7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1R1CQ8WVI7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1R1CQ8WVI7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1R1CQ8WVI7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1R1CQ8WVI7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1R1CQ8WVI7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1R1CQ8WVI7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1R1CQ8WVI7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1R1CQ8WVI7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPP1R1CQ8WVI7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP1R1CQ8WVI7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP1R1CQ8WVI7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP1R1CQ8WVI7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP1R1CQ8WVI7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP1R1CQ8WVI7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP1R1CQ8WVI7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP1R1CQ8WVI7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP1R1CQ8WVI7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP1R1CQ8WVI7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP1R1CQ8WVI7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP1R1CQ8WVI7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP1R1CQ8WVI7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP1R1CQ8WVI7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP1R1CQ8WVI7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP1R1CQ8WVI7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP1R1CQ8WVI7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PPP1R1CQ8WVI7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPP1R1CQ8WVI7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP1R1CQ8WVI7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP1R1CQ8WVI7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1R1CQ8WVI7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1R1CQ8WVI7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1R1CQ8WVI7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP1R1CQ8WVI7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP1R1CQ8WVI7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP1R1CQ8WVI7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP1R1CQ8WVI7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms