Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC107Q8WV48 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC107Q8WV48 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC107Q8WV48 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC107Q8WV48 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC107Q8WV48 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC107Q8WV48 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC107Q8WV48 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC107Q8WV48 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC107Q8WV48 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC107Q8WV48 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC107Q8WV48 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC107Q8WV48 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC107Q8WV48 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC107Q8WV48 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC107Q8WV48 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC107Q8WV48 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC107Q8WV48 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC107Q8WV48 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC107Q8WV48 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC107Q8WV48 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC107Q8WV48 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC107Q8WV48 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC107Q8WV48 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC107Q8WV48 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC107Q8WV48 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC107Q8WV48 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC107Q8WV48 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC107Q8WV48 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC107Q8WV48 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC107Q8WV48 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC107Q8WV48 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC107Q8WV48 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC107Q8WV48 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC107Q8WV48 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC107Q8WV48 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC107Q8WV48 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC107Q8WV48 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC107Q8WV48 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC107Q8WV48 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC107Q8WV48 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC107Q8WV48 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC107Q8WV48 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC107Q8WV48 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC107Q8WV48 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC107Q8WV48 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC107Q8WV48 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC107Q8WV48 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC107Q8WV48 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC107Q8WV48 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC107Q8WV48 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC107Q8WV48 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC107Q8WV48 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC107Q8WV48 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC107Q8WV48 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC107Q8WV48 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC107Q8WV48 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC107Q8WV48 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC107Q8WV48 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC107Q8WV48 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC107Q8WV48 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC107Q8WV48 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC107Q8WV48 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC107Q8WV48 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC107Q8WV48 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC107Q8WV48 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC107Q8WV48 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC107Q8WV48 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC107Q8WV48 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC107Q8WV48 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC107Q8WV48 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC107Q8WV48 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC107Q8WV48 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC107Q8WV48 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC107Q8WV48 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC107Q8WV48 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC107Q8WV48 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC107Q8WV48 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC107Q8WV48 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC107Q8WV48 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC107Q8WV48 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC107Q8WV48 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC107Q8WV48 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC107Q8WV48 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC107Q8WV48 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC107Q8WV48 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC107Q8WV48 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC107Q8WV48 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC107Q8WV48 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC107Q8WV48 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC107Q8WV48 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC107Q8WV48 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC107Q8WV48 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC107Q8WV48 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC107Q8WV48 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC107Q8WV48 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC107Q8WV48 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC107Q8WV48 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC107Q8WV48 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC107Q8WV48 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms