Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
DDX54Q8TDD1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
DDX54Q8TDD1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
DDX54Q8TDD1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC35.58■■■■□ 3.29
DDX54Q8TDD1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
DDX54Q8TDD1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
DDX54Q8TDD1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
DDX54Q8TDD1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
DDX54Q8TDD1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
DDX54Q8TDD1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
DDX54Q8TDD1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
DDX54Q8TDD1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
DDX54Q8TDD1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
DDX54Q8TDD1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
DDX54Q8TDD1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
DDX54Q8TDD1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
DDX54Q8TDD1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
DDX54Q8TDD1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
DDX54Q8TDD1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC35.49■■■■□ 3.27
DDX54Q8TDD1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
DDX54Q8TDD1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
DDX54Q8TDD1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
DDX54Q8TDD1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
DDX54Q8TDD1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
DDX54Q8TDD1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
DDX54Q8TDD1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
DDX54Q8TDD1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
DDX54Q8TDD1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
DDX54Q8TDD1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
DDX54Q8TDD1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
DDX54Q8TDD1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
DDX54Q8TDD1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
DDX54Q8TDD1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
DDX54Q8TDD1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
DDX54Q8TDD1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
DDX54Q8TDD1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
DDX54Q8TDD1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
DDX54Q8TDD1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
DDX54Q8TDD1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
DDX54Q8TDD1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
DDX54Q8TDD1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
DDX54Q8TDD1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
DDX54Q8TDD1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
DDX54Q8TDD1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
DDX54Q8TDD1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
DDX54Q8TDD1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
DDX54Q8TDD1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
DDX54Q8TDD1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
DDX54Q8TDD1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC35.34■■■■□ 3.25
DDX54Q8TDD1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
DDX54Q8TDD1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
DDX54Q8TDD1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
DDX54Q8TDD1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
DDX54Q8TDD1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
DDX54Q8TDD1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
DDX54Q8TDD1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
DDX54Q8TDD1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
DDX54Q8TDD1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
DDX54Q8TDD1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
DDX54Q8TDD1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
DDX54Q8TDD1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
DDX54Q8TDD1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
DDX54Q8TDD1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
DDX54Q8TDD1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
DDX54Q8TDD1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
DDX54Q8TDD1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
DDX54Q8TDD1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
DDX54Q8TDD1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
DDX54Q8TDD1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
DDX54Q8TDD1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
DDX54Q8TDD1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
DDX54Q8TDD1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
DDX54Q8TDD1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
DDX54Q8TDD1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
DDX54Q8TDD1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
DDX54Q8TDD1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
DDX54Q8TDD1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
DDX54Q8TDD1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
DDX54Q8TDD1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
DDX54Q8TDD1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
DDX54Q8TDD1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
DDX54Q8TDD1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
DDX54Q8TDD1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
DDX54Q8TDD1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
DDX54Q8TDD1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
DDX54Q8TDD1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
DDX54Q8TDD1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
DDX54Q8TDD1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
DDX54Q8TDD1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
DDX54Q8TDD1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
DDX54Q8TDD1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
DDX54Q8TDD1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
DDX54Q8TDD1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
DDX54Q8TDD1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
DDX54Q8TDD1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
DDX54Q8TDD1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
DDX54Q8TDD1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
DDX54Q8TDD1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
DDX54Q8TDD1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
DDX54Q8TDD1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms