Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS1

CLDND2, Claudin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND2Q8NHS1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDND2Q8NHS1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDND2Q8NHS1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDND2Q8NHS1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDND2Q8NHS1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDND2Q8NHS1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDND2Q8NHS1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDND2Q8NHS1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDND2Q8NHS1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDND2Q8NHS1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDND2Q8NHS1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDND2Q8NHS1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDND2Q8NHS1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDND2Q8NHS1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDND2Q8NHS1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDND2Q8NHS1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDND2Q8NHS1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDND2Q8NHS1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDND2Q8NHS1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDND2Q8NHS1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDND2Q8NHS1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDND2Q8NHS1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDND2Q8NHS1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDND2Q8NHS1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDND2Q8NHS1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDND2Q8NHS1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDND2Q8NHS1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDND2Q8NHS1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDND2Q8NHS1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDND2Q8NHS1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDND2Q8NHS1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDND2Q8NHS1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDND2Q8NHS1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDND2Q8NHS1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDND2Q8NHS1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDND2Q8NHS1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDND2Q8NHS1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDND2Q8NHS1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDND2Q8NHS1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDND2Q8NHS1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDND2Q8NHS1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDND2Q8NHS1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDND2Q8NHS1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDND2Q8NHS1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDND2Q8NHS1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDND2Q8NHS1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDND2Q8NHS1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDND2Q8NHS1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDND2Q8NHS1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDND2Q8NHS1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDND2Q8NHS1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDND2Q8NHS1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDND2Q8NHS1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDND2Q8NHS1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDND2Q8NHS1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDND2Q8NHS1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDND2Q8NHS1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDND2Q8NHS1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDND2Q8NHS1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDND2Q8NHS1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDND2Q8NHS1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDND2Q8NHS1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDND2Q8NHS1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDND2Q8NHS1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDND2Q8NHS1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDND2Q8NHS1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDND2Q8NHS1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDND2Q8NHS1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDND2Q8NHS1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDND2Q8NHS1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDND2Q8NHS1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDND2Q8NHS1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDND2Q8NHS1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDND2Q8NHS1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDND2Q8NHS1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDND2Q8NHS1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDND2Q8NHS1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDND2Q8NHS1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDND2Q8NHS1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDND2Q8NHS1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDND2Q8NHS1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDND2Q8NHS1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDND2Q8NHS1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDND2Q8NHS1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDND2Q8NHS1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDND2Q8NHS1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDND2Q8NHS1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDND2Q8NHS1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDND2Q8NHS1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDND2Q8NHS1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDND2Q8NHS1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDND2Q8NHS1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDND2Q8NHS1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDND2Q8NHS1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDND2Q8NHS1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDND2Q8NHS1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDND2Q8NHS1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDND2Q8NHS1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDND2Q8NHS1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDND2Q8NHS1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms