Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCF0

CLEC18C, C-type lectin domain family 18 member C, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC18CQ8NCF0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC18CQ8NCF0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC18CQ8NCF0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC18CQ8NCF0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC18CQ8NCF0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC18CQ8NCF0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC18CQ8NCF0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC18CQ8NCF0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLEC18CQ8NCF0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLEC18CQ8NCF0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLEC18CQ8NCF0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLEC18CQ8NCF0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC18CQ8NCF0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC18CQ8NCF0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC18CQ8NCF0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC18CQ8NCF0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLEC18CQ8NCF0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLEC18CQ8NCF0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLEC18CQ8NCF0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC18CQ8NCF0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC18CQ8NCF0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC18CQ8NCF0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC18CQ8NCF0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLEC18CQ8NCF0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLEC18CQ8NCF0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLEC18CQ8NCF0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLEC18CQ8NCF0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLEC18CQ8NCF0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CLEC18CQ8NCF0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLEC18CQ8NCF0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLEC18CQ8NCF0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLEC18CQ8NCF0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLEC18CQ8NCF0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLEC18CQ8NCF0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLEC18CQ8NCF0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLEC18CQ8NCF0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLEC18CQ8NCF0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLEC18CQ8NCF0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLEC18CQ8NCF0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLEC18CQ8NCF0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLEC18CQ8NCF0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLEC18CQ8NCF0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLEC18CQ8NCF0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLEC18CQ8NCF0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLEC18CQ8NCF0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLEC18CQ8NCF0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLEC18CQ8NCF0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLEC18CQ8NCF0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLEC18CQ8NCF0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLEC18CQ8NCF0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLEC18CQ8NCF0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLEC18CQ8NCF0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLEC18CQ8NCF0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLEC18CQ8NCF0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLEC18CQ8NCF0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLEC18CQ8NCF0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLEC18CQ8NCF0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLEC18CQ8NCF0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLEC18CQ8NCF0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLEC18CQ8NCF0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLEC18CQ8NCF0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLEC18CQ8NCF0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLEC18CQ8NCF0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLEC18CQ8NCF0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLEC18CQ8NCF0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLEC18CQ8NCF0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLEC18CQ8NCF0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLEC18CQ8NCF0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLEC18CQ8NCF0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLEC18CQ8NCF0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLEC18CQ8NCF0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLEC18CQ8NCF0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLEC18CQ8NCF0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLEC18CQ8NCF0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLEC18CQ8NCF0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLEC18CQ8NCF0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLEC18CQ8NCF0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLEC18CQ8NCF0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLEC18CQ8NCF0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLEC18CQ8NCF0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLEC18CQ8NCF0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLEC18CQ8NCF0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLEC18CQ8NCF0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLEC18CQ8NCF0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CLEC18CQ8NCF0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLEC18CQ8NCF0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLEC18CQ8NCF0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLEC18CQ8NCF0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLEC18CQ8NCF0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLEC18CQ8NCF0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLEC18CQ8NCF0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLEC18CQ8NCF0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLEC18CQ8NCF0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLEC18CQ8NCF0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLEC18CQ8NCF0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLEC18CQ8NCF0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLEC18CQ8NCF0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLEC18CQ8NCF0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLEC18CQ8NCF0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLEC18CQ8NCF0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms