Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z9

LMNTD1, Lamin tail domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD1Q8N9Z9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMNTD1Q8N9Z9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMNTD1Q8N9Z9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMNTD1Q8N9Z9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMNTD1Q8N9Z9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMNTD1Q8N9Z9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LMNTD1Q8N9Z9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMNTD1Q8N9Z9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMNTD1Q8N9Z9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMNTD1Q8N9Z9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMNTD1Q8N9Z9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMNTD1Q8N9Z9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMNTD1Q8N9Z9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMNTD1Q8N9Z9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMNTD1Q8N9Z9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMNTD1Q8N9Z9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMNTD1Q8N9Z9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMNTD1Q8N9Z9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMNTD1Q8N9Z9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMNTD1Q8N9Z9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMNTD1Q8N9Z9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMNTD1Q8N9Z9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMNTD1Q8N9Z9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMNTD1Q8N9Z9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMNTD1Q8N9Z9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMNTD1Q8N9Z9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMNTD1Q8N9Z9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMNTD1Q8N9Z9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNTD1Q8N9Z9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNTD1Q8N9Z9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNTD1Q8N9Z9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMNTD1Q8N9Z9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LMNTD1Q8N9Z9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LMNTD1Q8N9Z9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMNTD1Q8N9Z9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMNTD1Q8N9Z9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMNTD1Q8N9Z9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNTD1Q8N9Z9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNTD1Q8N9Z9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNTD1Q8N9Z9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNTD1Q8N9Z9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNTD1Q8N9Z9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNTD1Q8N9Z9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LMNTD1Q8N9Z9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LMNTD1Q8N9Z9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMNTD1Q8N9Z9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMNTD1Q8N9Z9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMNTD1Q8N9Z9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LMNTD1Q8N9Z9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMNTD1Q8N9Z9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMNTD1Q8N9Z9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMNTD1Q8N9Z9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMNTD1Q8N9Z9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMNTD1Q8N9Z9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMNTD1Q8N9Z9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMNTD1Q8N9Z9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMNTD1Q8N9Z9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMNTD1Q8N9Z9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMNTD1Q8N9Z9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMNTD1Q8N9Z9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMNTD1Q8N9Z9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMNTD1Q8N9Z9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMNTD1Q8N9Z9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMNTD1Q8N9Z9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMNTD1Q8N9Z9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LMNTD1Q8N9Z9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMNTD1Q8N9Z9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LMNTD1Q8N9Z9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMNTD1Q8N9Z9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMNTD1Q8N9Z9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMNTD1Q8N9Z9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMNTD1Q8N9Z9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMNTD1Q8N9Z9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMNTD1Q8N9Z9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMNTD1Q8N9Z9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMNTD1Q8N9Z9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMNTD1Q8N9Z9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMNTD1Q8N9Z9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMNTD1Q8N9Z9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMNTD1Q8N9Z9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LMNTD1Q8N9Z9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMNTD1Q8N9Z9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMNTD1Q8N9Z9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LMNTD1Q8N9Z9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMNTD1Q8N9Z9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMNTD1Q8N9Z9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMNTD1Q8N9Z9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMNTD1Q8N9Z9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMNTD1Q8N9Z9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMNTD1Q8N9Z9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMNTD1Q8N9Z9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMNTD1Q8N9Z9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMNTD1Q8N9Z9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMNTD1Q8N9Z9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMNTD1Q8N9Z9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMNTD1Q8N9Z9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMNTD1Q8N9Z9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMNTD1Q8N9Z9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms