Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9P6

C9orf163, Uncharacterized protein C9orf163, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf163Q8N9P6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf163Q8N9P6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf163Q8N9P6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf163Q8N9P6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf163Q8N9P6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf163Q8N9P6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf163Q8N9P6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf163Q8N9P6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf163Q8N9P6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf163Q8N9P6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf163Q8N9P6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf163Q8N9P6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf163Q8N9P6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf163Q8N9P6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf163Q8N9P6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf163Q8N9P6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf163Q8N9P6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf163Q8N9P6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf163Q8N9P6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf163Q8N9P6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf163Q8N9P6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf163Q8N9P6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf163Q8N9P6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf163Q8N9P6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
C9orf163Q8N9P6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf163Q8N9P6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf163Q8N9P6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf163Q8N9P6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf163Q8N9P6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf163Q8N9P6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf163Q8N9P6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf163Q8N9P6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf163Q8N9P6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf163Q8N9P6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf163Q8N9P6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf163Q8N9P6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf163Q8N9P6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf163Q8N9P6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf163Q8N9P6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf163Q8N9P6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf163Q8N9P6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf163Q8N9P6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf163Q8N9P6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf163Q8N9P6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf163Q8N9P6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf163Q8N9P6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf163Q8N9P6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf163Q8N9P6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf163Q8N9P6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf163Q8N9P6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf163Q8N9P6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf163Q8N9P6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf163Q8N9P6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf163Q8N9P6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf163Q8N9P6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf163Q8N9P6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf163Q8N9P6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf163Q8N9P6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf163Q8N9P6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf163Q8N9P6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf163Q8N9P6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf163Q8N9P6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf163Q8N9P6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf163Q8N9P6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf163Q8N9P6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf163Q8N9P6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf163Q8N9P6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf163Q8N9P6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf163Q8N9P6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf163Q8N9P6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf163Q8N9P6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf163Q8N9P6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf163Q8N9P6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf163Q8N9P6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf163Q8N9P6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf163Q8N9P6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf163Q8N9P6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf163Q8N9P6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf163Q8N9P6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf163Q8N9P6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf163Q8N9P6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf163Q8N9P6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf163Q8N9P6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf163Q8N9P6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf163Q8N9P6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf163Q8N9P6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf163Q8N9P6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf163Q8N9P6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf163Q8N9P6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf163Q8N9P6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf163Q8N9P6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf163Q8N9P6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf163Q8N9P6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf163Q8N9P6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf163Q8N9P6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf163Q8N9P6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf163Q8N9P6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf163Q8N9P6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf163Q8N9P6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf163Q8N9P6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms