Protein–RNA interactions for Protein: Q8N816

TMEM99, Transmembrane protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM99Q8N816 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM99Q8N816 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM99Q8N816 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM99Q8N816 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM99Q8N816 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM99Q8N816 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM99Q8N816 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM99Q8N816 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM99Q8N816 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM99Q8N816 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM99Q8N816 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM99Q8N816 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM99Q8N816 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM99Q8N816 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM99Q8N816 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM99Q8N816 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM99Q8N816 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM99Q8N816 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM99Q8N816 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM99Q8N816 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM99Q8N816 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM99Q8N816 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM99Q8N816 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM99Q8N816 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM99Q8N816 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM99Q8N816 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM99Q8N816 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM99Q8N816 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM99Q8N816 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM99Q8N816 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM99Q8N816 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM99Q8N816 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM99Q8N816 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM99Q8N816 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM99Q8N816 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM99Q8N816 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM99Q8N816 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM99Q8N816 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM99Q8N816 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM99Q8N816 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM99Q8N816 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM99Q8N816 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM99Q8N816 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM99Q8N816 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM99Q8N816 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM99Q8N816 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM99Q8N816 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM99Q8N816 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM99Q8N816 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM99Q8N816 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM99Q8N816 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM99Q8N816 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM99Q8N816 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM99Q8N816 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM99Q8N816 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM99Q8N816 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM99Q8N816 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM99Q8N816 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM99Q8N816 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM99Q8N816 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM99Q8N816 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM99Q8N816 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM99Q8N816 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM99Q8N816 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM99Q8N816 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM99Q8N816 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM99Q8N816 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM99Q8N816 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM99Q8N816 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM99Q8N816 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM99Q8N816 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM99Q8N816 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM99Q8N816 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM99Q8N816 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM99Q8N816 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM99Q8N816 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM99Q8N816 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM99Q8N816 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM99Q8N816 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM99Q8N816 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM99Q8N816 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM99Q8N816 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM99Q8N816 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM99Q8N816 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM99Q8N816 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM99Q8N816 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM99Q8N816 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM99Q8N816 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM99Q8N816 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM99Q8N816 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM99Q8N816 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM99Q8N816 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM99Q8N816 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM99Q8N816 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM99Q8N816 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM99Q8N816 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM99Q8N816 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM99Q8N816 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM99Q8N816 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM99Q8N816 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms