Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G1

LINC00337, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00337, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00337Q8N6G1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00337Q8N6G1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00337Q8N6G1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00337Q8N6G1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00337Q8N6G1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00337Q8N6G1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00337Q8N6G1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00337Q8N6G1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LINC00337Q8N6G1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00337Q8N6G1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00337Q8N6G1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00337Q8N6G1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00337Q8N6G1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00337Q8N6G1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00337Q8N6G1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00337Q8N6G1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00337Q8N6G1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00337Q8N6G1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00337Q8N6G1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00337Q8N6G1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00337Q8N6G1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00337Q8N6G1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00337Q8N6G1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00337Q8N6G1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00337Q8N6G1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00337Q8N6G1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00337Q8N6G1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00337Q8N6G1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00337Q8N6G1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00337Q8N6G1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00337Q8N6G1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00337Q8N6G1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00337Q8N6G1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00337Q8N6G1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00337Q8N6G1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00337Q8N6G1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00337Q8N6G1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00337Q8N6G1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00337Q8N6G1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00337Q8N6G1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00337Q8N6G1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00337Q8N6G1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00337Q8N6G1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00337Q8N6G1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00337Q8N6G1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00337Q8N6G1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00337Q8N6G1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00337Q8N6G1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00337Q8N6G1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00337Q8N6G1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00337Q8N6G1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00337Q8N6G1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00337Q8N6G1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00337Q8N6G1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00337Q8N6G1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00337Q8N6G1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00337Q8N6G1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00337Q8N6G1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00337Q8N6G1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00337Q8N6G1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00337Q8N6G1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00337Q8N6G1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00337Q8N6G1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00337Q8N6G1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00337Q8N6G1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00337Q8N6G1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00337Q8N6G1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00337Q8N6G1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00337Q8N6G1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00337Q8N6G1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00337Q8N6G1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00337Q8N6G1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00337Q8N6G1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00337Q8N6G1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00337Q8N6G1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00337Q8N6G1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00337Q8N6G1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00337Q8N6G1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00337Q8N6G1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00337Q8N6G1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00337Q8N6G1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00337Q8N6G1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00337Q8N6G1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00337Q8N6G1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00337Q8N6G1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00337Q8N6G1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00337Q8N6G1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00337Q8N6G1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00337Q8N6G1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00337Q8N6G1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00337Q8N6G1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00337Q8N6G1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00337Q8N6G1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00337Q8N6G1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00337Q8N6G1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00337Q8N6G1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00337Q8N6G1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00337Q8N6G1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00337Q8N6G1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00337Q8N6G1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.9 ms