Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4A0

GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT4Q8N4A0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GALNT4Q8N4A0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GALNT4Q8N4A0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GALNT4Q8N4A0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GALNT4Q8N4A0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GALNT4Q8N4A0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GALNT4Q8N4A0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GALNT4Q8N4A0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GALNT4Q8N4A0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GALNT4Q8N4A0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GALNT4Q8N4A0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GALNT4Q8N4A0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GALNT4Q8N4A0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GALNT4Q8N4A0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GALNT4Q8N4A0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GALNT4Q8N4A0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GALNT4Q8N4A0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GALNT4Q8N4A0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GALNT4Q8N4A0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GALNT4Q8N4A0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GALNT4Q8N4A0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GALNT4Q8N4A0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GALNT4Q8N4A0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GALNT4Q8N4A0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GALNT4Q8N4A0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GALNT4Q8N4A0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GALNT4Q8N4A0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GALNT4Q8N4A0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GALNT4Q8N4A0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GALNT4Q8N4A0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GALNT4Q8N4A0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GALNT4Q8N4A0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GALNT4Q8N4A0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GALNT4Q8N4A0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GALNT4Q8N4A0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GALNT4Q8N4A0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GALNT4Q8N4A0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GALNT4Q8N4A0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GALNT4Q8N4A0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GALNT4Q8N4A0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GALNT4Q8N4A0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GALNT4Q8N4A0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GALNT4Q8N4A0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GALNT4Q8N4A0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GALNT4Q8N4A0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GALNT4Q8N4A0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GALNT4Q8N4A0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GALNT4Q8N4A0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GALNT4Q8N4A0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GALNT4Q8N4A0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GALNT4Q8N4A0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GALNT4Q8N4A0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GALNT4Q8N4A0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GALNT4Q8N4A0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GALNT4Q8N4A0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GALNT4Q8N4A0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GALNT4Q8N4A0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GALNT4Q8N4A0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GALNT4Q8N4A0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GALNT4Q8N4A0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GALNT4Q8N4A0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GALNT4Q8N4A0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GALNT4Q8N4A0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GALNT4Q8N4A0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GALNT4Q8N4A0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GALNT4Q8N4A0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GALNT4Q8N4A0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GALNT4Q8N4A0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GALNT4Q8N4A0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GALNT4Q8N4A0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GALNT4Q8N4A0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GALNT4Q8N4A0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GALNT4Q8N4A0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GALNT4Q8N4A0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GALNT4Q8N4A0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GALNT4Q8N4A0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GALNT4Q8N4A0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GALNT4Q8N4A0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GALNT4Q8N4A0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GALNT4Q8N4A0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GALNT4Q8N4A0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GALNT4Q8N4A0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GALNT4Q8N4A0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GALNT4Q8N4A0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GALNT4Q8N4A0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GALNT4Q8N4A0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GALNT4Q8N4A0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GALNT4Q8N4A0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GALNT4Q8N4A0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GALNT4Q8N4A0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GALNT4Q8N4A0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GALNT4Q8N4A0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GALNT4Q8N4A0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GALNT4Q8N4A0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GALNT4Q8N4A0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GALNT4Q8N4A0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GALNT4Q8N4A0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GALNT4Q8N4A0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GALNT4Q8N4A0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GALNT4Q8N4A0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms