Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U1

Putative uncharacterized protein LOC400692, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N3U1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8N3U1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8N3U1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8N3U1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8N3U1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8N3U1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8N3U1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8N3U1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8N3U1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8N3U1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8N3U1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8N3U1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8N3U1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8N3U1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8N3U1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8N3U1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8N3U1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8N3U1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8N3U1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q8N3U1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q8N3U1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q8N3U1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q8N3U1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q8N3U1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q8N3U1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q8N3U1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q8N3U1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q8N3U1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q8N3U1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q8N3U1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q8N3U1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q8N3U1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q8N3U1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q8N3U1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q8N3U1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q8N3U1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q8N3U1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q8N3U1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q8N3U1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q8N3U1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q8N3U1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q8N3U1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q8N3U1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q8N3U1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q8N3U1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q8N3U1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q8N3U1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q8N3U1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q8N3U1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q8N3U1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q8N3U1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q8N3U1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q8N3U1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q8N3U1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q8N3U1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q8N3U1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q8N3U1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q8N3U1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q8N3U1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q8N3U1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q8N3U1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q8N3U1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8N3U1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8N3U1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8N3U1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8N3U1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8N3U1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8N3U1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8N3U1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8N3U1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8N3U1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8N3U1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8N3U1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8N3U1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8N3U1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q8N3U1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8N3U1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8N3U1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8N3U1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8N3U1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8N3U1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8N3U1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8N3U1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8N3U1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8N3U1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8N3U1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8N3U1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8N3U1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8N3U1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8N3U1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8N3U1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8N3U1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8N3U1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8N3U1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8N3U1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8N3U1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8N3U1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8N3U1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8N3U1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8N3U1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms