Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2K1

UBE2J2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J2Q8N2K1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2J2Q8N2K1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2J2Q8N2K1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2J2Q8N2K1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2J2Q8N2K1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2J2Q8N2K1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE2J2Q8N2K1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE2J2Q8N2K1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE2J2Q8N2K1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE2J2Q8N2K1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE2J2Q8N2K1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE2J2Q8N2K1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBE2J2Q8N2K1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE2J2Q8N2K1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE2J2Q8N2K1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE2J2Q8N2K1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE2J2Q8N2K1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE2J2Q8N2K1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2J2Q8N2K1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2J2Q8N2K1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2J2Q8N2K1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2J2Q8N2K1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2J2Q8N2K1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2J2Q8N2K1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2J2Q8N2K1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2J2Q8N2K1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2J2Q8N2K1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2J2Q8N2K1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2J2Q8N2K1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2J2Q8N2K1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2J2Q8N2K1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2J2Q8N2K1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2J2Q8N2K1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2J2Q8N2K1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2J2Q8N2K1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2J2Q8N2K1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2J2Q8N2K1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2J2Q8N2K1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2J2Q8N2K1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2J2Q8N2K1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2J2Q8N2K1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2J2Q8N2K1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2J2Q8N2K1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2J2Q8N2K1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2J2Q8N2K1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2J2Q8N2K1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2J2Q8N2K1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2J2Q8N2K1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2J2Q8N2K1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE2J2Q8N2K1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE2J2Q8N2K1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2J2Q8N2K1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2J2Q8N2K1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2J2Q8N2K1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE2J2Q8N2K1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE2J2Q8N2K1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE2J2Q8N2K1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE2J2Q8N2K1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBE2J2Q8N2K1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE2J2Q8N2K1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE2J2Q8N2K1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE2J2Q8N2K1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE2J2Q8N2K1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE2J2Q8N2K1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE2J2Q8N2K1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE2J2Q8N2K1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE2J2Q8N2K1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE2J2Q8N2K1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE2J2Q8N2K1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE2J2Q8N2K1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE2J2Q8N2K1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE2J2Q8N2K1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE2J2Q8N2K1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE2J2Q8N2K1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE2J2Q8N2K1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE2J2Q8N2K1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE2J2Q8N2K1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE2J2Q8N2K1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE2J2Q8N2K1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE2J2Q8N2K1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE2J2Q8N2K1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE2J2Q8N2K1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE2J2Q8N2K1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE2J2Q8N2K1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE2J2Q8N2K1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2J2Q8N2K1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2J2Q8N2K1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2J2Q8N2K1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2J2Q8N2K1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2J2Q8N2K1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2J2Q8N2K1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2J2Q8N2K1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2J2Q8N2K1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2J2Q8N2K1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2J2Q8N2K1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2J2Q8N2K1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2J2Q8N2K1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2J2Q8N2K1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2J2Q8N2K1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2J2Q8N2K1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms