Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2H9

PELI3, E3 ubiquitin-protein ligase pellino homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PELI3Q8N2H9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PELI3Q8N2H9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PELI3Q8N2H9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PELI3Q8N2H9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PELI3Q8N2H9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PELI3Q8N2H9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PELI3Q8N2H9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PELI3Q8N2H9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PELI3Q8N2H9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PELI3Q8N2H9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PELI3Q8N2H9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PELI3Q8N2H9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PELI3Q8N2H9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PELI3Q8N2H9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PELI3Q8N2H9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PELI3Q8N2H9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PELI3Q8N2H9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PELI3Q8N2H9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PELI3Q8N2H9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PELI3Q8N2H9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PELI3Q8N2H9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PELI3Q8N2H9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PELI3Q8N2H9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PELI3Q8N2H9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PELI3Q8N2H9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PELI3Q8N2H9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PELI3Q8N2H9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PELI3Q8N2H9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PELI3Q8N2H9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PELI3Q8N2H9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PELI3Q8N2H9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PELI3Q8N2H9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PELI3Q8N2H9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PELI3Q8N2H9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PELI3Q8N2H9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PELI3Q8N2H9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PELI3Q8N2H9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PELI3Q8N2H9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PELI3Q8N2H9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PELI3Q8N2H9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PELI3Q8N2H9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PELI3Q8N2H9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PELI3Q8N2H9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PELI3Q8N2H9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PELI3Q8N2H9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PELI3Q8N2H9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PELI3Q8N2H9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PELI3Q8N2H9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PELI3Q8N2H9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PELI3Q8N2H9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PELI3Q8N2H9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PELI3Q8N2H9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PELI3Q8N2H9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PELI3Q8N2H9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PELI3Q8N2H9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PELI3Q8N2H9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PELI3Q8N2H9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PELI3Q8N2H9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PELI3Q8N2H9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PELI3Q8N2H9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PELI3Q8N2H9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PELI3Q8N2H9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PELI3Q8N2H9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PELI3Q8N2H9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PELI3Q8N2H9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PELI3Q8N2H9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PELI3Q8N2H9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PELI3Q8N2H9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PELI3Q8N2H9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PELI3Q8N2H9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PELI3Q8N2H9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PELI3Q8N2H9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PELI3Q8N2H9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PELI3Q8N2H9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PELI3Q8N2H9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PELI3Q8N2H9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PELI3Q8N2H9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PELI3Q8N2H9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PELI3Q8N2H9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PELI3Q8N2H9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PELI3Q8N2H9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PELI3Q8N2H9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PELI3Q8N2H9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PELI3Q8N2H9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PELI3Q8N2H9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PELI3Q8N2H9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PELI3Q8N2H9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PELI3Q8N2H9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PELI3Q8N2H9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PELI3Q8N2H9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PELI3Q8N2H9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PELI3Q8N2H9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PELI3Q8N2H9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PELI3Q8N2H9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PELI3Q8N2H9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PELI3Q8N2H9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PELI3Q8N2H9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PELI3Q8N2H9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PELI3Q8N2H9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PELI3Q8N2H9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms