Protein–RNA interactions for Protein: Q8N126

CADM3, Cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM3Q8N126 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CADM3Q8N126 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CADM3Q8N126 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CADM3Q8N126 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CADM3Q8N126 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CADM3Q8N126 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CADM3Q8N126 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CADM3Q8N126 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CADM3Q8N126 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CADM3Q8N126 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CADM3Q8N126 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CADM3Q8N126 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CADM3Q8N126 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CADM3Q8N126 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CADM3Q8N126 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CADM3Q8N126 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CADM3Q8N126 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CADM3Q8N126 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CADM3Q8N126 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CADM3Q8N126 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CADM3Q8N126 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CADM3Q8N126 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CADM3Q8N126 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CADM3Q8N126 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CADM3Q8N126 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CADM3Q8N126 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CADM3Q8N126 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CADM3Q8N126 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CADM3Q8N126 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CADM3Q8N126 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CADM3Q8N126 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CADM3Q8N126 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CADM3Q8N126 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CADM3Q8N126 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CADM3Q8N126 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CADM3Q8N126 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CADM3Q8N126 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CADM3Q8N126 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CADM3Q8N126 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CADM3Q8N126 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CADM3Q8N126 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CADM3Q8N126 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CADM3Q8N126 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CADM3Q8N126 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CADM3Q8N126 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CADM3Q8N126 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CADM3Q8N126 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CADM3Q8N126 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CADM3Q8N126 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CADM3Q8N126 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CADM3Q8N126 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CADM3Q8N126 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CADM3Q8N126 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CADM3Q8N126 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CADM3Q8N126 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CADM3Q8N126 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CADM3Q8N126 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CADM3Q8N126 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CADM3Q8N126 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CADM3Q8N126 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CADM3Q8N126 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CADM3Q8N126 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CADM3Q8N126 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CADM3Q8N126 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CADM3Q8N126 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CADM3Q8N126 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CADM3Q8N126 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CADM3Q8N126 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CADM3Q8N126 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CADM3Q8N126 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CADM3Q8N126 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CADM3Q8N126 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CADM3Q8N126 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CADM3Q8N126 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CADM3Q8N126 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CADM3Q8N126 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CADM3Q8N126 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CADM3Q8N126 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CADM3Q8N126 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CADM3Q8N126 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CADM3Q8N126 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CADM3Q8N126 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CADM3Q8N126 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CADM3Q8N126 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CADM3Q8N126 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CADM3Q8N126 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CADM3Q8N126 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CADM3Q8N126 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CADM3Q8N126 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CADM3Q8N126 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CADM3Q8N126 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CADM3Q8N126 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CADM3Q8N126 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CADM3Q8N126 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CADM3Q8N126 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CADM3Q8N126 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CADM3Q8N126 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CADM3Q8N126 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CADM3Q8N126 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CADM3Q8N126 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms