Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYE1

CCDC13, Coiled-coil domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13Q8IYE1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC13Q8IYE1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC13Q8IYE1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC13Q8IYE1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC13Q8IYE1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC13Q8IYE1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC13Q8IYE1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC13Q8IYE1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC13Q8IYE1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC13Q8IYE1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC13Q8IYE1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC13Q8IYE1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC13Q8IYE1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC13Q8IYE1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC13Q8IYE1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC13Q8IYE1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC13Q8IYE1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC13Q8IYE1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC13Q8IYE1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC13Q8IYE1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC13Q8IYE1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC13Q8IYE1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC13Q8IYE1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC13Q8IYE1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC13Q8IYE1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC13Q8IYE1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC13Q8IYE1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC13Q8IYE1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC13Q8IYE1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC13Q8IYE1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC13Q8IYE1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC13Q8IYE1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC13Q8IYE1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC13Q8IYE1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC13Q8IYE1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC13Q8IYE1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC13Q8IYE1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC13Q8IYE1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC13Q8IYE1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC13Q8IYE1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC13Q8IYE1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC13Q8IYE1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC13Q8IYE1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC13Q8IYE1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC13Q8IYE1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC13Q8IYE1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC13Q8IYE1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC13Q8IYE1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC13Q8IYE1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC13Q8IYE1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC13Q8IYE1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC13Q8IYE1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC13Q8IYE1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC13Q8IYE1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC13Q8IYE1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC13Q8IYE1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC13Q8IYE1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC13Q8IYE1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC13Q8IYE1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC13Q8IYE1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC13Q8IYE1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC13Q8IYE1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC13Q8IYE1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC13Q8IYE1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC13Q8IYE1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC13Q8IYE1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC13Q8IYE1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC13Q8IYE1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC13Q8IYE1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC13Q8IYE1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC13Q8IYE1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC13Q8IYE1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC13Q8IYE1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC13Q8IYE1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC13Q8IYE1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC13Q8IYE1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC13Q8IYE1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC13Q8IYE1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC13Q8IYE1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC13Q8IYE1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC13Q8IYE1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC13Q8IYE1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC13Q8IYE1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC13Q8IYE1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC13Q8IYE1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC13Q8IYE1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC13Q8IYE1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC13Q8IYE1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC13Q8IYE1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC13Q8IYE1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC13Q8IYE1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC13Q8IYE1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC13Q8IYE1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC13Q8IYE1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC13Q8IYE1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC13Q8IYE1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC13Q8IYE1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC13Q8IYE1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC13Q8IYE1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC13Q8IYE1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms