Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC71Q8IV32 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC71Q8IV32 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC71Q8IV32 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC71Q8IV32 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC71Q8IV32 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC71Q8IV32 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC71Q8IV32 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC71Q8IV32 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC71Q8IV32 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC71Q8IV32 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC71Q8IV32 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC71Q8IV32 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC71Q8IV32 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC71Q8IV32 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC71Q8IV32 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC71Q8IV32 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC71Q8IV32 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC71Q8IV32 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC71Q8IV32 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC71Q8IV32 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC71Q8IV32 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC71Q8IV32 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC71Q8IV32 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC71Q8IV32 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC71Q8IV32 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC71Q8IV32 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC71Q8IV32 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC71Q8IV32 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC71Q8IV32 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC71Q8IV32 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC71Q8IV32 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC71Q8IV32 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC71Q8IV32 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC71Q8IV32 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC71Q8IV32 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC71Q8IV32 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC71Q8IV32 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC71Q8IV32 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC71Q8IV32 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC71Q8IV32 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC71Q8IV32 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC71Q8IV32 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC71Q8IV32 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC71Q8IV32 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC71Q8IV32 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC71Q8IV32 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC71Q8IV32 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC71Q8IV32 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC71Q8IV32 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC71Q8IV32 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC71Q8IV32 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC71Q8IV32 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC71Q8IV32 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC71Q8IV32 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC71Q8IV32 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC71Q8IV32 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC71Q8IV32 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC71Q8IV32 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC71Q8IV32 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC71Q8IV32 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC71Q8IV32 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC71Q8IV32 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC71Q8IV32 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC71Q8IV32 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC71Q8IV32 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC71Q8IV32 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC71Q8IV32 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC71Q8IV32 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC71Q8IV32 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC71Q8IV32 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC71Q8IV32 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC71Q8IV32 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC71Q8IV32 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC71Q8IV32 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC71Q8IV32 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC71Q8IV32 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC71Q8IV32 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC71Q8IV32 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC71Q8IV32 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC71Q8IV32 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC71Q8IV32 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC71Q8IV32 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC71Q8IV32 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC71Q8IV32 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC71Q8IV32 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC71Q8IV32 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC71Q8IV32 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC71Q8IV32 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC71Q8IV32 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC71Q8IV32 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC71Q8IV32 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC71Q8IV32 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC71Q8IV32 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC71Q8IV32 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC71Q8IV32 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC71Q8IV32 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC71Q8IV32 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC71Q8IV32 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC71Q8IV32 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms