Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS6

RAB43, Ras-related protein Rab-43, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB43Q86YS6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB43Q86YS6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB43Q86YS6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB43Q86YS6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB43Q86YS6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB43Q86YS6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB43Q86YS6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB43Q86YS6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB43Q86YS6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB43Q86YS6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB43Q86YS6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB43Q86YS6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB43Q86YS6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB43Q86YS6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB43Q86YS6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB43Q86YS6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB43Q86YS6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB43Q86YS6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB43Q86YS6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB43Q86YS6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB43Q86YS6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB43Q86YS6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB43Q86YS6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB43Q86YS6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB43Q86YS6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB43Q86YS6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB43Q86YS6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB43Q86YS6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB43Q86YS6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB43Q86YS6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB43Q86YS6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB43Q86YS6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB43Q86YS6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB43Q86YS6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB43Q86YS6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB43Q86YS6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB43Q86YS6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB43Q86YS6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB43Q86YS6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB43Q86YS6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB43Q86YS6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB43Q86YS6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB43Q86YS6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB43Q86YS6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB43Q86YS6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB43Q86YS6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB43Q86YS6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB43Q86YS6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB43Q86YS6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB43Q86YS6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB43Q86YS6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB43Q86YS6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB43Q86YS6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB43Q86YS6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB43Q86YS6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB43Q86YS6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB43Q86YS6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB43Q86YS6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB43Q86YS6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB43Q86YS6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB43Q86YS6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB43Q86YS6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB43Q86YS6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB43Q86YS6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB43Q86YS6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB43Q86YS6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB43Q86YS6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB43Q86YS6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB43Q86YS6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB43Q86YS6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB43Q86YS6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB43Q86YS6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB43Q86YS6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB43Q86YS6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB43Q86YS6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB43Q86YS6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB43Q86YS6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB43Q86YS6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB43Q86YS6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB43Q86YS6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB43Q86YS6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB43Q86YS6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB43Q86YS6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB43Q86YS6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB43Q86YS6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB43Q86YS6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB43Q86YS6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB43Q86YS6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB43Q86YS6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB43Q86YS6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB43Q86YS6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB43Q86YS6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB43Q86YS6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB43Q86YS6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB43Q86YS6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB43Q86YS6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB43Q86YS6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB43Q86YS6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB43Q86YS6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB43Q86YS6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms