Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK3

SFR1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFR1Q86XK3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SFR1Q86XK3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SFR1Q86XK3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SFR1Q86XK3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SFR1Q86XK3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SFR1Q86XK3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SFR1Q86XK3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SFR1Q86XK3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SFR1Q86XK3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SFR1Q86XK3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SFR1Q86XK3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SFR1Q86XK3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SFR1Q86XK3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SFR1Q86XK3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SFR1Q86XK3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SFR1Q86XK3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SFR1Q86XK3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SFR1Q86XK3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SFR1Q86XK3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SFR1Q86XK3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SFR1Q86XK3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SFR1Q86XK3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SFR1Q86XK3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SFR1Q86XK3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SFR1Q86XK3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SFR1Q86XK3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SFR1Q86XK3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SFR1Q86XK3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SFR1Q86XK3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SFR1Q86XK3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SFR1Q86XK3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SFR1Q86XK3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SFR1Q86XK3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SFR1Q86XK3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SFR1Q86XK3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SFR1Q86XK3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SFR1Q86XK3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SFR1Q86XK3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SFR1Q86XK3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SFR1Q86XK3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SFR1Q86XK3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SFR1Q86XK3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SFR1Q86XK3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SFR1Q86XK3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SFR1Q86XK3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SFR1Q86XK3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SFR1Q86XK3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SFR1Q86XK3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SFR1Q86XK3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SFR1Q86XK3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SFR1Q86XK3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SFR1Q86XK3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SFR1Q86XK3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SFR1Q86XK3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SFR1Q86XK3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SFR1Q86XK3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SFR1Q86XK3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SFR1Q86XK3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SFR1Q86XK3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SFR1Q86XK3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SFR1Q86XK3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SFR1Q86XK3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SFR1Q86XK3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SFR1Q86XK3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SFR1Q86XK3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SFR1Q86XK3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SFR1Q86XK3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SFR1Q86XK3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SFR1Q86XK3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SFR1Q86XK3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SFR1Q86XK3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SFR1Q86XK3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SFR1Q86XK3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SFR1Q86XK3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SFR1Q86XK3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SFR1Q86XK3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SFR1Q86XK3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SFR1Q86XK3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SFR1Q86XK3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SFR1Q86XK3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SFR1Q86XK3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SFR1Q86XK3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SFR1Q86XK3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SFR1Q86XK3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SFR1Q86XK3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SFR1Q86XK3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SFR1Q86XK3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SFR1Q86XK3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SFR1Q86XK3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SFR1Q86XK3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SFR1Q86XK3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SFR1Q86XK3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SFR1Q86XK3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SFR1Q86XK3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SFR1Q86XK3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SFR1Q86XK3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SFR1Q86XK3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SFR1Q86XK3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SFR1Q86XK3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SFR1Q86XK3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms