Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
NLRP13Q86W25 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NLRP13Q86W25 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
NLRP13Q86W25 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NLRP13Q86W25 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NLRP13Q86W25 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NLRP13Q86W25 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NLRP13Q86W25 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NLRP13Q86W25 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NLRP13Q86W25 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
NLRP13Q86W25 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
NLRP13Q86W25 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
NLRP13Q86W25 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
NLRP13Q86W25 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC37.13■■■■□ 3.53
NLRP13Q86W25 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC37.13■■■■□ 3.53
NLRP13Q86W25 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
NLRP13Q86W25 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
NLRP13Q86W25 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
NLRP13Q86W25 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
NLRP13Q86W25 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
NLRP13Q86W25 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
NLRP13Q86W25 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
NLRP13Q86W25 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NLRP13Q86W25 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NLRP13Q86W25 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
NLRP13Q86W25 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
NLRP13Q86W25 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
NLRP13Q86W25 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
NLRP13Q86W25 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
NLRP13Q86W25 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
NLRP13Q86W25 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
NLRP13Q86W25 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
NLRP13Q86W25 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
NLRP13Q86W25 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
NLRP13Q86W25 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
NLRP13Q86W25 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
NLRP13Q86W25 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
NLRP13Q86W25 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
NLRP13Q86W25 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NLRP13Q86W25 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
NLRP13Q86W25 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NLRP13Q86W25 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NLRP13Q86W25 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
NLRP13Q86W25 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NLRP13Q86W25 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NLRP13Q86W25 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
NLRP13Q86W25 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NLRP13Q86W25 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
NLRP13Q86W25 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
NLRP13Q86W25 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NLRP13Q86W25 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NLRP13Q86W25 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NLRP13Q86W25 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NLRP13Q86W25 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
NLRP13Q86W25 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NLRP13Q86W25 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NLRP13Q86W25 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NLRP13Q86W25 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NLRP13Q86W25 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NLRP13Q86W25 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NLRP13Q86W25 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NLRP13Q86W25 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
NLRP13Q86W25 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NLRP13Q86W25 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
NLRP13Q86W25 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NLRP13Q86W25 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NLRP13Q86W25 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NLRP13Q86W25 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NLRP13Q86W25 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NLRP13Q86W25 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.8■■■■□ 3.48
NLRP13Q86W25 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NLRP13Q86W25 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NLRP13Q86W25 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
NLRP13Q86W25 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
NLRP13Q86W25 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
NLRP13Q86W25 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
NLRP13Q86W25 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
NLRP13Q86W25 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
NLRP13Q86W25 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NLRP13Q86W25 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.77■■■■□ 3.48
NLRP13Q86W25 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
NLRP13Q86W25 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
NLRP13Q86W25 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
NLRP13Q86W25 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
NLRP13Q86W25 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
NLRP13Q86W25 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
NLRP13Q86W25 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
NLRP13Q86W25 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NLRP13Q86W25 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NLRP13Q86W25 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NLRP13Q86W25 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NLRP13Q86W25 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NLRP13Q86W25 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
NLRP13Q86W25 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
NLRP13Q86W25 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NLRP13Q86W25 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
NLRP13Q86W25 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NLRP13Q86W25 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NLRP13Q86W25 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NLRP13Q86W25 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms