Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG4DQ86TL0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG4DQ86TL0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG4DQ86TL0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG4DQ86TL0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG4DQ86TL0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG4DQ86TL0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG4DQ86TL0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG4DQ86TL0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG4DQ86TL0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG4DQ86TL0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG4DQ86TL0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG4DQ86TL0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG4DQ86TL0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG4DQ86TL0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG4DQ86TL0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG4DQ86TL0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG4DQ86TL0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG4DQ86TL0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG4DQ86TL0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG4DQ86TL0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG4DQ86TL0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG4DQ86TL0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG4DQ86TL0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG4DQ86TL0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG4DQ86TL0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG4DQ86TL0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG4DQ86TL0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG4DQ86TL0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG4DQ86TL0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG4DQ86TL0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG4DQ86TL0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG4DQ86TL0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG4DQ86TL0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG4DQ86TL0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG4DQ86TL0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG4DQ86TL0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG4DQ86TL0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG4DQ86TL0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG4DQ86TL0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG4DQ86TL0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG4DQ86TL0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG4DQ86TL0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4DQ86TL0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4DQ86TL0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4DQ86TL0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4DQ86TL0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4DQ86TL0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG4DQ86TL0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG4DQ86TL0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG4DQ86TL0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG4DQ86TL0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG4DQ86TL0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG4DQ86TL0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG4DQ86TL0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG4DQ86TL0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG4DQ86TL0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG4DQ86TL0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG4DQ86TL0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG4DQ86TL0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG4DQ86TL0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG4DQ86TL0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG4DQ86TL0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG4DQ86TL0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG4DQ86TL0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG4DQ86TL0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG4DQ86TL0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG4DQ86TL0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG4DQ86TL0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG4DQ86TL0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG4DQ86TL0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG4DQ86TL0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG4DQ86TL0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG4DQ86TL0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG4DQ86TL0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG4DQ86TL0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG4DQ86TL0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG4DQ86TL0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG4DQ86TL0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG4DQ86TL0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG4DQ86TL0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG4DQ86TL0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ATG4DQ86TL0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATG4DQ86TL0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG4DQ86TL0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG4DQ86TL0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG4DQ86TL0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG4DQ86TL0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG4DQ86TL0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG4DQ86TL0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG4DQ86TL0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG4DQ86TL0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG4DQ86TL0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG4DQ86TL0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG4DQ86TL0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG4DQ86TL0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG4DQ86TL0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG4DQ86TL0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG4DQ86TL0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG4DQ86TL0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms