Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT9Q86SS6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT9Q86SS6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT9Q86SS6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT9Q86SS6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT9Q86SS6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT9Q86SS6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT9Q86SS6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT9Q86SS6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT9Q86SS6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT9Q86SS6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT9Q86SS6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT9Q86SS6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT9Q86SS6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT9Q86SS6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT9Q86SS6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYT9Q86SS6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYT9Q86SS6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYT9Q86SS6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT9Q86SS6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT9Q86SS6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT9Q86SS6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT9Q86SS6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT9Q86SS6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT9Q86SS6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT9Q86SS6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT9Q86SS6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT9Q86SS6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT9Q86SS6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT9Q86SS6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT9Q86SS6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT9Q86SS6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT9Q86SS6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT9Q86SS6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT9Q86SS6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT9Q86SS6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT9Q86SS6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT9Q86SS6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT9Q86SS6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT9Q86SS6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT9Q86SS6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT9Q86SS6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT9Q86SS6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT9Q86SS6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT9Q86SS6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT9Q86SS6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYT9Q86SS6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYT9Q86SS6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYT9Q86SS6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYT9Q86SS6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYT9Q86SS6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYT9Q86SS6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SYT9Q86SS6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYT9Q86SS6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYT9Q86SS6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYT9Q86SS6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SYT9Q86SS6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYT9Q86SS6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYT9Q86SS6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYT9Q86SS6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT9Q86SS6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT9Q86SS6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT9Q86SS6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT9Q86SS6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT9Q86SS6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT9Q86SS6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT9Q86SS6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT9Q86SS6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT9Q86SS6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYT9Q86SS6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT9Q86SS6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT9Q86SS6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT9Q86SS6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT9Q86SS6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT9Q86SS6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT9Q86SS6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT9Q86SS6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT9Q86SS6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT9Q86SS6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYT9Q86SS6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYT9Q86SS6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYT9Q86SS6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYT9Q86SS6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYT9Q86SS6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT9Q86SS6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT9Q86SS6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT9Q86SS6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT9Q86SS6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT9Q86SS6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT9Q86SS6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT9Q86SS6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT9Q86SS6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT9Q86SS6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT9Q86SS6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT9Q86SS6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT9Q86SS6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT9Q86SS6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT9Q86SS6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT9Q86SS6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT9Q86SS6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms