Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4I7

LIMS2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS2Q7Z4I7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LIMS2Q7Z4I7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LIMS2Q7Z4I7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LIMS2Q7Z4I7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LIMS2Q7Z4I7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LIMS2Q7Z4I7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LIMS2Q7Z4I7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LIMS2Q7Z4I7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LIMS2Q7Z4I7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LIMS2Q7Z4I7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
LIMS2Q7Z4I7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LIMS2Q7Z4I7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LIMS2Q7Z4I7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LIMS2Q7Z4I7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LIMS2Q7Z4I7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LIMS2Q7Z4I7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LIMS2Q7Z4I7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LIMS2Q7Z4I7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LIMS2Q7Z4I7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LIMS2Q7Z4I7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LIMS2Q7Z4I7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LIMS2Q7Z4I7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LIMS2Q7Z4I7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LIMS2Q7Z4I7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LIMS2Q7Z4I7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LIMS2Q7Z4I7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LIMS2Q7Z4I7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LIMS2Q7Z4I7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LIMS2Q7Z4I7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LIMS2Q7Z4I7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LIMS2Q7Z4I7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LIMS2Q7Z4I7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LIMS2Q7Z4I7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LIMS2Q7Z4I7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LIMS2Q7Z4I7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LIMS2Q7Z4I7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LIMS2Q7Z4I7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LIMS2Q7Z4I7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LIMS2Q7Z4I7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LIMS2Q7Z4I7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LIMS2Q7Z4I7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
LIMS2Q7Z4I7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LIMS2Q7Z4I7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LIMS2Q7Z4I7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LIMS2Q7Z4I7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LIMS2Q7Z4I7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LIMS2Q7Z4I7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LIMS2Q7Z4I7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LIMS2Q7Z4I7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LIMS2Q7Z4I7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LIMS2Q7Z4I7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LIMS2Q7Z4I7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LIMS2Q7Z4I7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LIMS2Q7Z4I7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LIMS2Q7Z4I7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LIMS2Q7Z4I7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LIMS2Q7Z4I7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LIMS2Q7Z4I7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LIMS2Q7Z4I7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LIMS2Q7Z4I7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LIMS2Q7Z4I7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LIMS2Q7Z4I7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LIMS2Q7Z4I7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LIMS2Q7Z4I7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LIMS2Q7Z4I7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LIMS2Q7Z4I7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LIMS2Q7Z4I7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LIMS2Q7Z4I7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LIMS2Q7Z4I7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LIMS2Q7Z4I7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LIMS2Q7Z4I7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LIMS2Q7Z4I7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LIMS2Q7Z4I7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LIMS2Q7Z4I7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LIMS2Q7Z4I7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LIMS2Q7Z4I7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LIMS2Q7Z4I7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LIMS2Q7Z4I7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LIMS2Q7Z4I7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LIMS2Q7Z4I7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LIMS2Q7Z4I7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LIMS2Q7Z4I7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LIMS2Q7Z4I7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LIMS2Q7Z4I7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LIMS2Q7Z4I7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LIMS2Q7Z4I7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LIMS2Q7Z4I7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LIMS2Q7Z4I7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LIMS2Q7Z4I7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LIMS2Q7Z4I7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LIMS2Q7Z4I7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LIMS2Q7Z4I7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LIMS2Q7Z4I7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LIMS2Q7Z4I7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LIMS2Q7Z4I7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LIMS2Q7Z4I7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LIMS2Q7Z4I7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LIMS2Q7Z4I7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LIMS2Q7Z4I7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LIMS2Q7Z4I7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1147.1 ms