Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3D4

LYSMD3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD3Q7Z3D4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LYSMD3Q7Z3D4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LYSMD3Q7Z3D4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LYSMD3Q7Z3D4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LYSMD3Q7Z3D4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LYSMD3Q7Z3D4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LYSMD3Q7Z3D4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LYSMD3Q7Z3D4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LYSMD3Q7Z3D4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LYSMD3Q7Z3D4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LYSMD3Q7Z3D4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LYSMD3Q7Z3D4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LYSMD3Q7Z3D4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LYSMD3Q7Z3D4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LYSMD3Q7Z3D4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LYSMD3Q7Z3D4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LYSMD3Q7Z3D4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LYSMD3Q7Z3D4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LYSMD3Q7Z3D4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LYSMD3Q7Z3D4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LYSMD3Q7Z3D4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LYSMD3Q7Z3D4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LYSMD3Q7Z3D4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LYSMD3Q7Z3D4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LYSMD3Q7Z3D4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LYSMD3Q7Z3D4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LYSMD3Q7Z3D4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LYSMD3Q7Z3D4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LYSMD3Q7Z3D4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LYSMD3Q7Z3D4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LYSMD3Q7Z3D4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LYSMD3Q7Z3D4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LYSMD3Q7Z3D4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LYSMD3Q7Z3D4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LYSMD3Q7Z3D4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LYSMD3Q7Z3D4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LYSMD3Q7Z3D4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LYSMD3Q7Z3D4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LYSMD3Q7Z3D4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LYSMD3Q7Z3D4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LYSMD3Q7Z3D4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LYSMD3Q7Z3D4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LYSMD3Q7Z3D4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LYSMD3Q7Z3D4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LYSMD3Q7Z3D4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LYSMD3Q7Z3D4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LYSMD3Q7Z3D4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LYSMD3Q7Z3D4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LYSMD3Q7Z3D4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LYSMD3Q7Z3D4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LYSMD3Q7Z3D4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LYSMD3Q7Z3D4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LYSMD3Q7Z3D4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LYSMD3Q7Z3D4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LYSMD3Q7Z3D4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LYSMD3Q7Z3D4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LYSMD3Q7Z3D4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LYSMD3Q7Z3D4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LYSMD3Q7Z3D4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LYSMD3Q7Z3D4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LYSMD3Q7Z3D4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LYSMD3Q7Z3D4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LYSMD3Q7Z3D4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LYSMD3Q7Z3D4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LYSMD3Q7Z3D4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LYSMD3Q7Z3D4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LYSMD3Q7Z3D4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LYSMD3Q7Z3D4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LYSMD3Q7Z3D4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LYSMD3Q7Z3D4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LYSMD3Q7Z3D4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LYSMD3Q7Z3D4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LYSMD3Q7Z3D4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LYSMD3Q7Z3D4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LYSMD3Q7Z3D4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LYSMD3Q7Z3D4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LYSMD3Q7Z3D4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LYSMD3Q7Z3D4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LYSMD3Q7Z3D4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LYSMD3Q7Z3D4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LYSMD3Q7Z3D4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LYSMD3Q7Z3D4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LYSMD3Q7Z3D4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LYSMD3Q7Z3D4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LYSMD3Q7Z3D4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LYSMD3Q7Z3D4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LYSMD3Q7Z3D4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LYSMD3Q7Z3D4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LYSMD3Q7Z3D4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LYSMD3Q7Z3D4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LYSMD3Q7Z3D4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LYSMD3Q7Z3D4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LYSMD3Q7Z3D4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LYSMD3Q7Z3D4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LYSMD3Q7Z3D4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LYSMD3Q7Z3D4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LYSMD3Q7Z3D4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LYSMD3Q7Z3D4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LYSMD3Q7Z3D4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LYSMD3Q7Z3D4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms