Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDXQ7Z353 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDXQ7Z353 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDXQ7Z353 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDXQ7Z353 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDXQ7Z353 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDXQ7Z353 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDXQ7Z353 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDXQ7Z353 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HDXQ7Z353 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HDXQ7Z353 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HDXQ7Z353 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HDXQ7Z353 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HDXQ7Z353 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HDXQ7Z353 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDXQ7Z353 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDXQ7Z353 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDXQ7Z353 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDXQ7Z353 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDXQ7Z353 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDXQ7Z353 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDXQ7Z353 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDXQ7Z353 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
HDXQ7Z353 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
HDXQ7Z353 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDXQ7Z353 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDXQ7Z353 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDXQ7Z353 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDXQ7Z353 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HDXQ7Z353 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDXQ7Z353 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDXQ7Z353 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDXQ7Z353 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDXQ7Z353 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDXQ7Z353 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDXQ7Z353 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDXQ7Z353 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDXQ7Z353 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDXQ7Z353 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HDXQ7Z353 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDXQ7Z353 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDXQ7Z353 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDXQ7Z353 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDXQ7Z353 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDXQ7Z353 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HDXQ7Z353 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDXQ7Z353 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDXQ7Z353 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDXQ7Z353 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
HDXQ7Z353 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HDXQ7Z353 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDXQ7Z353 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDXQ7Z353 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDXQ7Z353 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDXQ7Z353 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDXQ7Z353 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDXQ7Z353 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDXQ7Z353 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDXQ7Z353 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDXQ7Z353 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDXQ7Z353 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDXQ7Z353 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDXQ7Z353 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDXQ7Z353 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HDXQ7Z353 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HDXQ7Z353 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HDXQ7Z353 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HDXQ7Z353 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HDXQ7Z353 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HDXQ7Z353 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HDXQ7Z353 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HDXQ7Z353 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HDXQ7Z353 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HDXQ7Z353 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HDXQ7Z353 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HDXQ7Z353 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HDXQ7Z353 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HDXQ7Z353 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HDXQ7Z353 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HDXQ7Z353 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDXQ7Z353 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDXQ7Z353 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDXQ7Z353 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDXQ7Z353 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HDXQ7Z353 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HDXQ7Z353 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDXQ7Z353 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDXQ7Z353 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDXQ7Z353 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDXQ7Z353 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDXQ7Z353 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDXQ7Z353 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDXQ7Z353 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HDXQ7Z353 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HDXQ7Z353 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HDXQ7Z353 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDXQ7Z353 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDXQ7Z353 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDXQ7Z353 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDXQ7Z353 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms