Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF23Q7RTU1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF23Q7RTU1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF23Q7RTU1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF23Q7RTU1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF23Q7RTU1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF23Q7RTU1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCF23Q7RTU1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCF23Q7RTU1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCF23Q7RTU1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF23Q7RTU1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF23Q7RTU1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF23Q7RTU1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF23Q7RTU1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF23Q7RTU1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF23Q7RTU1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF23Q7RTU1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF23Q7RTU1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF23Q7RTU1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF23Q7RTU1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF23Q7RTU1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF23Q7RTU1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TCF23Q7RTU1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF23Q7RTU1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF23Q7RTU1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF23Q7RTU1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF23Q7RTU1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF23Q7RTU1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCF23Q7RTU1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TCF23Q7RTU1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCF23Q7RTU1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF23Q7RTU1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF23Q7RTU1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF23Q7RTU1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF23Q7RTU1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF23Q7RTU1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF23Q7RTU1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF23Q7RTU1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF23Q7RTU1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF23Q7RTU1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCF23Q7RTU1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCF23Q7RTU1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF23Q7RTU1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF23Q7RTU1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCF23Q7RTU1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TCF23Q7RTU1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCF23Q7RTU1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCF23Q7RTU1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF23Q7RTU1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF23Q7RTU1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF23Q7RTU1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCF23Q7RTU1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TCF23Q7RTU1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCF23Q7RTU1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCF23Q7RTU1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF23Q7RTU1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF23Q7RTU1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF23Q7RTU1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF23Q7RTU1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF23Q7RTU1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF23Q7RTU1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF23Q7RTU1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF23Q7RTU1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF23Q7RTU1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF23Q7RTU1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF23Q7RTU1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF23Q7RTU1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF23Q7RTU1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF23Q7RTU1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF23Q7RTU1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF23Q7RTU1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF23Q7RTU1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF23Q7RTU1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF23Q7RTU1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF23Q7RTU1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF23Q7RTU1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF23Q7RTU1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF23Q7RTU1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF23Q7RTU1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF23Q7RTU1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCF23Q7RTU1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCF23Q7RTU1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCF23Q7RTU1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCF23Q7RTU1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCF23Q7RTU1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF23Q7RTU1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF23Q7RTU1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF23Q7RTU1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF23Q7RTU1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF23Q7RTU1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF23Q7RTU1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF23Q7RTU1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCF23Q7RTU1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCF23Q7RTU1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCF23Q7RTU1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCF23Q7RTU1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCF23Q7RTU1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCF23Q7RTU1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCF23Q7RTU1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCF23Q7RTU1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms