Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
SMIM5Q71RC9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
SMIM5Q71RC9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SMIM5Q71RC9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SMIM5Q71RC9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SMIM5Q71RC9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SMIM5Q71RC9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SMIM5Q71RC9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SMIM5Q71RC9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
SMIM5Q71RC9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SMIM5Q71RC9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SMIM5Q71RC9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SMIM5Q71RC9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SMIM5Q71RC9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SMIM5Q71RC9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SMIM5Q71RC9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SMIM5Q71RC9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SMIM5Q71RC9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SMIM5Q71RC9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
SMIM5Q71RC9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SMIM5Q71RC9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SMIM5Q71RC9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SMIM5Q71RC9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SMIM5Q71RC9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SMIM5Q71RC9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SMIM5Q71RC9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SMIM5Q71RC9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SMIM5Q71RC9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SMIM5Q71RC9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SMIM5Q71RC9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SMIM5Q71RC9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
SMIM5Q71RC9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SMIM5Q71RC9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SMIM5Q71RC9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SMIM5Q71RC9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SMIM5Q71RC9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SMIM5Q71RC9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SMIM5Q71RC9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SMIM5Q71RC9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SMIM5Q71RC9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SMIM5Q71RC9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SMIM5Q71RC9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SMIM5Q71RC9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SMIM5Q71RC9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SMIM5Q71RC9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SMIM5Q71RC9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SMIM5Q71RC9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SMIM5Q71RC9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SMIM5Q71RC9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SMIM5Q71RC9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SMIM5Q71RC9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SMIM5Q71RC9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SMIM5Q71RC9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SMIM5Q71RC9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SMIM5Q71RC9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SMIM5Q71RC9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SMIM5Q71RC9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SMIM5Q71RC9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SMIM5Q71RC9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SMIM5Q71RC9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SMIM5Q71RC9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SMIM5Q71RC9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SMIM5Q71RC9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SMIM5Q71RC9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SMIM5Q71RC9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SMIM5Q71RC9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SMIM5Q71RC9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
SMIM5Q71RC9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SMIM5Q71RC9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SMIM5Q71RC9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SMIM5Q71RC9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SMIM5Q71RC9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SMIM5Q71RC9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SMIM5Q71RC9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SMIM5Q71RC9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SMIM5Q71RC9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SMIM5Q71RC9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SMIM5Q71RC9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SMIM5Q71RC9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SMIM5Q71RC9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMIM5Q71RC9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SMIM5Q71RC9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SMIM5Q71RC9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SMIM5Q71RC9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SMIM5Q71RC9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SMIM5Q71RC9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMIM5Q71RC9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
SMIM5Q71RC9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
SMIM5Q71RC9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
SMIM5Q71RC9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
SMIM5Q71RC9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
SMIM5Q71RC9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
SMIM5Q71RC9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
SMIM5Q71RC9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
SMIM5Q71RC9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
SMIM5Q71RC9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SMIM5Q71RC9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SMIM5Q71RC9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SMIM5Q71RC9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SMIM5Q71RC9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms