Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED13LQ71F56 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED13LQ71F56 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MED13LQ71F56 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED13LQ71F56 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED13LQ71F56 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MED13LQ71F56 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED13LQ71F56 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED13LQ71F56 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED13LQ71F56 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MED13LQ71F56 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MED13LQ71F56 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED13LQ71F56 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED13LQ71F56 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED13LQ71F56 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED13LQ71F56 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED13LQ71F56 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED13LQ71F56 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED13LQ71F56 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED13LQ71F56 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MED13LQ71F56 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MED13LQ71F56 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MED13LQ71F56 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED13LQ71F56 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED13LQ71F56 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED13LQ71F56 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED13LQ71F56 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED13LQ71F56 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED13LQ71F56 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED13LQ71F56 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED13LQ71F56 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED13LQ71F56 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED13LQ71F56 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MED13LQ71F56 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED13LQ71F56 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED13LQ71F56 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED13LQ71F56 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED13LQ71F56 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MED13LQ71F56 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED13LQ71F56 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED13LQ71F56 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED13LQ71F56 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED13LQ71F56 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED13LQ71F56 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED13LQ71F56 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED13LQ71F56 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED13LQ71F56 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED13LQ71F56 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED13LQ71F56 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED13LQ71F56 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED13LQ71F56 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED13LQ71F56 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED13LQ71F56 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED13LQ71F56 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED13LQ71F56 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED13LQ71F56 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED13LQ71F56 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED13LQ71F56 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED13LQ71F56 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED13LQ71F56 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED13LQ71F56 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED13LQ71F56 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED13LQ71F56 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MED13LQ71F56 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED13LQ71F56 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MED13LQ71F56 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED13LQ71F56 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MED13LQ71F56 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED13LQ71F56 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED13LQ71F56 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED13LQ71F56 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED13LQ71F56 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED13LQ71F56 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED13LQ71F56 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED13LQ71F56 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED13LQ71F56 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED13LQ71F56 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED13LQ71F56 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED13LQ71F56 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED13LQ71F56 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED13LQ71F56 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED13LQ71F56 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED13LQ71F56 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED13LQ71F56 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MED13LQ71F56 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms