Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RFX8Q6ZV50 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFX8Q6ZV50 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFX8Q6ZV50 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFX8Q6ZV50 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFX8Q6ZV50 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFX8Q6ZV50 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFX8Q6ZV50 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RFX8Q6ZV50 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFX8Q6ZV50 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFX8Q6ZV50 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RFX8Q6ZV50 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFX8Q6ZV50 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RFX8Q6ZV50 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RFX8Q6ZV50 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RFX8Q6ZV50 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RFX8Q6ZV50 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RFX8Q6ZV50 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RFX8Q6ZV50 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RFX8Q6ZV50 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RFX8Q6ZV50 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
RFX8Q6ZV50 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RFX8Q6ZV50 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RFX8Q6ZV50 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RFX8Q6ZV50 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFX8Q6ZV50 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFX8Q6ZV50 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFX8Q6ZV50 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFX8Q6ZV50 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFX8Q6ZV50 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RFX8Q6ZV50 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RFX8Q6ZV50 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RFX8Q6ZV50 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RFX8Q6ZV50 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RFX8Q6ZV50 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RFX8Q6ZV50 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
RFX8Q6ZV50 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RFX8Q6ZV50 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFX8Q6ZV50 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFX8Q6ZV50 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFX8Q6ZV50 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFX8Q6ZV50 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFX8Q6ZV50 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RFX8Q6ZV50 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFX8Q6ZV50 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFX8Q6ZV50 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFX8Q6ZV50 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RFX8Q6ZV50 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RFX8Q6ZV50 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFX8Q6ZV50 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RFX8Q6ZV50 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RFX8Q6ZV50 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RFX8Q6ZV50 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RFX8Q6ZV50 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RFX8Q6ZV50 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RFX8Q6ZV50 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RFX8Q6ZV50 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RFX8Q6ZV50 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RFX8Q6ZV50 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RFX8Q6ZV50 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RFX8Q6ZV50 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RFX8Q6ZV50 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RFX8Q6ZV50 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RFX8Q6ZV50 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RFX8Q6ZV50 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RFX8Q6ZV50 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RFX8Q6ZV50 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RFX8Q6ZV50 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RFX8Q6ZV50 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RFX8Q6ZV50 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RFX8Q6ZV50 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RFX8Q6ZV50 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RFX8Q6ZV50 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RFX8Q6ZV50 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RFX8Q6ZV50 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RFX8Q6ZV50 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RFX8Q6ZV50 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RFX8Q6ZV50 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RFX8Q6ZV50 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RFX8Q6ZV50 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RFX8Q6ZV50 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RFX8Q6ZV50 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RFX8Q6ZV50 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RFX8Q6ZV50 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RFX8Q6ZV50 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RFX8Q6ZV50 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RFX8Q6ZV50 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RFX8Q6ZV50 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RFX8Q6ZV50 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RFX8Q6ZV50 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RFX8Q6ZV50 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RFX8Q6ZV50 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RFX8Q6ZV50 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RFX8Q6ZV50 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RFX8Q6ZV50 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RFX8Q6ZV50 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RFX8Q6ZV50 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RFX8Q6ZV50 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RFX8Q6ZV50 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RFX8Q6ZV50 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms