Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZS62

COLCA1, Colorectal cancer-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA1Q6ZS62 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COLCA1Q6ZS62 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COLCA1Q6ZS62 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COLCA1Q6ZS62 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COLCA1Q6ZS62 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COLCA1Q6ZS62 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COLCA1Q6ZS62 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COLCA1Q6ZS62 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COLCA1Q6ZS62 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COLCA1Q6ZS62 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COLCA1Q6ZS62 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COLCA1Q6ZS62 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COLCA1Q6ZS62 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COLCA1Q6ZS62 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COLCA1Q6ZS62 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
COLCA1Q6ZS62 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COLCA1Q6ZS62 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COLCA1Q6ZS62 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COLCA1Q6ZS62 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COLCA1Q6ZS62 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COLCA1Q6ZS62 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COLCA1Q6ZS62 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COLCA1Q6ZS62 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COLCA1Q6ZS62 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COLCA1Q6ZS62 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COLCA1Q6ZS62 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COLCA1Q6ZS62 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COLCA1Q6ZS62 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COLCA1Q6ZS62 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COLCA1Q6ZS62 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COLCA1Q6ZS62 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COLCA1Q6ZS62 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
COLCA1Q6ZS62 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COLCA1Q6ZS62 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COLCA1Q6ZS62 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLCA1Q6ZS62 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLCA1Q6ZS62 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLCA1Q6ZS62 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COLCA1Q6ZS62 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COLCA1Q6ZS62 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COLCA1Q6ZS62 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COLCA1Q6ZS62 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COLCA1Q6ZS62 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COLCA1Q6ZS62 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COLCA1Q6ZS62 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COLCA1Q6ZS62 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COLCA1Q6ZS62 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COLCA1Q6ZS62 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COLCA1Q6ZS62 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COLCA1Q6ZS62 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COLCA1Q6ZS62 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COLCA1Q6ZS62 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COLCA1Q6ZS62 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COLCA1Q6ZS62 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COLCA1Q6ZS62 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COLCA1Q6ZS62 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COLCA1Q6ZS62 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COLCA1Q6ZS62 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COLCA1Q6ZS62 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COLCA1Q6ZS62 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COLCA1Q6ZS62 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COLCA1Q6ZS62 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COLCA1Q6ZS62 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COLCA1Q6ZS62 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COLCA1Q6ZS62 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COLCA1Q6ZS62 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COLCA1Q6ZS62 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COLCA1Q6ZS62 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COLCA1Q6ZS62 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COLCA1Q6ZS62 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COLCA1Q6ZS62 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
COLCA1Q6ZS62 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COLCA1Q6ZS62 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COLCA1Q6ZS62 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
COLCA1Q6ZS62 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COLCA1Q6ZS62 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COLCA1Q6ZS62 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COLCA1Q6ZS62 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COLCA1Q6ZS62 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COLCA1Q6ZS62 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COLCA1Q6ZS62 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLCA1Q6ZS62 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLCA1Q6ZS62 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COLCA1Q6ZS62 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COLCA1Q6ZS62 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COLCA1Q6ZS62 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COLCA1Q6ZS62 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COLCA1Q6ZS62 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COLCA1Q6ZS62 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLCA1Q6ZS62 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLCA1Q6ZS62 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COLCA1Q6ZS62 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COLCA1Q6ZS62 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COLCA1Q6ZS62 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COLCA1Q6ZS62 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COLCA1Q6ZS62 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COLCA1Q6ZS62 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COLCA1Q6ZS62 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COLCA1Q6ZS62 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COLCA1Q6ZS62 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms