Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRI6

C15orf39, Uncharacterized protein C15orf39, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf39Q6ZRI6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
C15orf39Q6ZRI6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
C15orf39Q6ZRI6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
C15orf39Q6ZRI6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
C15orf39Q6ZRI6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
C15orf39Q6ZRI6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
C15orf39Q6ZRI6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
C15orf39Q6ZRI6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
C15orf39Q6ZRI6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
C15orf39Q6ZRI6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
C15orf39Q6ZRI6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
C15orf39Q6ZRI6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
C15orf39Q6ZRI6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
C15orf39Q6ZRI6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
C15orf39Q6ZRI6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
C15orf39Q6ZRI6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
C15orf39Q6ZRI6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
C15orf39Q6ZRI6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
C15orf39Q6ZRI6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
C15orf39Q6ZRI6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
C15orf39Q6ZRI6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
C15orf39Q6ZRI6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
C15orf39Q6ZRI6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
C15orf39Q6ZRI6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
C15orf39Q6ZRI6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
C15orf39Q6ZRI6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
C15orf39Q6ZRI6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
C15orf39Q6ZRI6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
C15orf39Q6ZRI6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
C15orf39Q6ZRI6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
C15orf39Q6ZRI6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
C15orf39Q6ZRI6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
C15orf39Q6ZRI6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
C15orf39Q6ZRI6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C15orf39Q6ZRI6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C15orf39Q6ZRI6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C15orf39Q6ZRI6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
C15orf39Q6ZRI6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C15orf39Q6ZRI6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
C15orf39Q6ZRI6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
C15orf39Q6ZRI6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
C15orf39Q6ZRI6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
C15orf39Q6ZRI6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
C15orf39Q6ZRI6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
C15orf39Q6ZRI6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
C15orf39Q6ZRI6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
C15orf39Q6ZRI6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
C15orf39Q6ZRI6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
C15orf39Q6ZRI6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
C15orf39Q6ZRI6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
C15orf39Q6ZRI6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
C15orf39Q6ZRI6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
C15orf39Q6ZRI6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
C15orf39Q6ZRI6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
C15orf39Q6ZRI6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
C15orf39Q6ZRI6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
C15orf39Q6ZRI6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
C15orf39Q6ZRI6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
C15orf39Q6ZRI6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
C15orf39Q6ZRI6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
C15orf39Q6ZRI6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
C15orf39Q6ZRI6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
C15orf39Q6ZRI6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
C15orf39Q6ZRI6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
C15orf39Q6ZRI6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
C15orf39Q6ZRI6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
C15orf39Q6ZRI6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
C15orf39Q6ZRI6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
C15orf39Q6ZRI6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
C15orf39Q6ZRI6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
C15orf39Q6ZRI6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
C15orf39Q6ZRI6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
C15orf39Q6ZRI6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
C15orf39Q6ZRI6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
C15orf39Q6ZRI6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
C15orf39Q6ZRI6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
C15orf39Q6ZRI6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
C15orf39Q6ZRI6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
C15orf39Q6ZRI6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
C15orf39Q6ZRI6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
C15orf39Q6ZRI6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
C15orf39Q6ZRI6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
C15orf39Q6ZRI6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
C15orf39Q6ZRI6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
C15orf39Q6ZRI6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
C15orf39Q6ZRI6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
C15orf39Q6ZRI6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
C15orf39Q6ZRI6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
C15orf39Q6ZRI6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
C15orf39Q6ZRI6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
C15orf39Q6ZRI6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
C15orf39Q6ZRI6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
C15orf39Q6ZRI6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
C15orf39Q6ZRI6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
C15orf39Q6ZRI6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
C15orf39Q6ZRI6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
C15orf39Q6ZRI6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
C15orf39Q6ZRI6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
C15orf39Q6ZRI6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
C15orf39Q6ZRI6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms