Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN54

DEF8, Differentially expressed in FDCP 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEF8Q6ZN54 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DEF8Q6ZN54 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DEF8Q6ZN54 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DEF8Q6ZN54 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DEF8Q6ZN54 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DEF8Q6ZN54 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DEF8Q6ZN54 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DEF8Q6ZN54 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DEF8Q6ZN54 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DEF8Q6ZN54 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DEF8Q6ZN54 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DEF8Q6ZN54 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DEF8Q6ZN54 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DEF8Q6ZN54 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DEF8Q6ZN54 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DEF8Q6ZN54 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DEF8Q6ZN54 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DEF8Q6ZN54 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DEF8Q6ZN54 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DEF8Q6ZN54 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DEF8Q6ZN54 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DEF8Q6ZN54 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DEF8Q6ZN54 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DEF8Q6ZN54 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DEF8Q6ZN54 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DEF8Q6ZN54 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DEF8Q6ZN54 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DEF8Q6ZN54 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DEF8Q6ZN54 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DEF8Q6ZN54 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DEF8Q6ZN54 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DEF8Q6ZN54 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DEF8Q6ZN54 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DEF8Q6ZN54 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DEF8Q6ZN54 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DEF8Q6ZN54 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DEF8Q6ZN54 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEF8Q6ZN54 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEF8Q6ZN54 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEF8Q6ZN54 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DEF8Q6ZN54 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DEF8Q6ZN54 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DEF8Q6ZN54 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DEF8Q6ZN54 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DEF8Q6ZN54 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DEF8Q6ZN54 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DEF8Q6ZN54 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DEF8Q6ZN54 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DEF8Q6ZN54 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DEF8Q6ZN54 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DEF8Q6ZN54 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DEF8Q6ZN54 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DEF8Q6ZN54 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DEF8Q6ZN54 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEF8Q6ZN54 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEF8Q6ZN54 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEF8Q6ZN54 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DEF8Q6ZN54 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DEF8Q6ZN54 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DEF8Q6ZN54 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DEF8Q6ZN54 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DEF8Q6ZN54 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DEF8Q6ZN54 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DEF8Q6ZN54 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DEF8Q6ZN54 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DEF8Q6ZN54 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DEF8Q6ZN54 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DEF8Q6ZN54 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DEF8Q6ZN54 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DEF8Q6ZN54 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEF8Q6ZN54 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEF8Q6ZN54 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEF8Q6ZN54 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEF8Q6ZN54 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEF8Q6ZN54 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DEF8Q6ZN54 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DEF8Q6ZN54 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DEF8Q6ZN54 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEF8Q6ZN54 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEF8Q6ZN54 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DEF8Q6ZN54 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DEF8Q6ZN54 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DEF8Q6ZN54 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DEF8Q6ZN54 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DEF8Q6ZN54 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DEF8Q6ZN54 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEF8Q6ZN54 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEF8Q6ZN54 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEF8Q6ZN54 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEF8Q6ZN54 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEF8Q6ZN54 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEF8Q6ZN54 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEF8Q6ZN54 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEF8Q6ZN54 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEF8Q6ZN54 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEF8Q6ZN54 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEF8Q6ZN54 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DEF8Q6ZN54 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DEF8Q6ZN54 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DEF8Q6ZN54 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms