Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN03

LINC00322, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00322, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00322Q6ZN03 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00322Q6ZN03 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00322Q6ZN03 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00322Q6ZN03 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00322Q6ZN03 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00322Q6ZN03 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00322Q6ZN03 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00322Q6ZN03 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00322Q6ZN03 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00322Q6ZN03 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00322Q6ZN03 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00322Q6ZN03 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00322Q6ZN03 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00322Q6ZN03 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00322Q6ZN03 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00322Q6ZN03 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00322Q6ZN03 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00322Q6ZN03 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00322Q6ZN03 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00322Q6ZN03 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00322Q6ZN03 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00322Q6ZN03 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00322Q6ZN03 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00322Q6ZN03 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00322Q6ZN03 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00322Q6ZN03 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00322Q6ZN03 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00322Q6ZN03 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00322Q6ZN03 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00322Q6ZN03 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00322Q6ZN03 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00322Q6ZN03 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00322Q6ZN03 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00322Q6ZN03 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00322Q6ZN03 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00322Q6ZN03 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00322Q6ZN03 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00322Q6ZN03 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00322Q6ZN03 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00322Q6ZN03 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00322Q6ZN03 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00322Q6ZN03 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00322Q6ZN03 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00322Q6ZN03 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00322Q6ZN03 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00322Q6ZN03 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00322Q6ZN03 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00322Q6ZN03 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00322Q6ZN03 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00322Q6ZN03 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00322Q6ZN03 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00322Q6ZN03 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00322Q6ZN03 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC00322Q6ZN03 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00322Q6ZN03 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00322Q6ZN03 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00322Q6ZN03 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00322Q6ZN03 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00322Q6ZN03 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00322Q6ZN03 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00322Q6ZN03 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00322Q6ZN03 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00322Q6ZN03 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00322Q6ZN03 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00322Q6ZN03 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00322Q6ZN03 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00322Q6ZN03 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00322Q6ZN03 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00322Q6ZN03 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00322Q6ZN03 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00322Q6ZN03 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00322Q6ZN03 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00322Q6ZN03 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00322Q6ZN03 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00322Q6ZN03 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00322Q6ZN03 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00322Q6ZN03 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00322Q6ZN03 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00322Q6ZN03 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00322Q6ZN03 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00322Q6ZN03 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00322Q6ZN03 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00322Q6ZN03 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00322Q6ZN03 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00322Q6ZN03 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00322Q6ZN03 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00322Q6ZN03 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00322Q6ZN03 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00322Q6ZN03 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00322Q6ZN03 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00322Q6ZN03 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00322Q6ZN03 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00322Q6ZN03 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00322Q6ZN03 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00322Q6ZN03 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00322Q6ZN03 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00322Q6ZN03 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00322Q6ZN03 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00322Q6ZN03 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00322Q6ZN03 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms