Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC36A4Q6YBV0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC36A4Q6YBV0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC36A4Q6YBV0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC36A4Q6YBV0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC36A4Q6YBV0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC36A4Q6YBV0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC36A4Q6YBV0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC36A4Q6YBV0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC36A4Q6YBV0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC36A4Q6YBV0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC36A4Q6YBV0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC36A4Q6YBV0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC36A4Q6YBV0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC36A4Q6YBV0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC36A4Q6YBV0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC36A4Q6YBV0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SLC36A4Q6YBV0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC36A4Q6YBV0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC36A4Q6YBV0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC36A4Q6YBV0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC36A4Q6YBV0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC36A4Q6YBV0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC36A4Q6YBV0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC36A4Q6YBV0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC36A4Q6YBV0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC36A4Q6YBV0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC36A4Q6YBV0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC36A4Q6YBV0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC36A4Q6YBV0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC36A4Q6YBV0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC36A4Q6YBV0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC36A4Q6YBV0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC36A4Q6YBV0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC36A4Q6YBV0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC36A4Q6YBV0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC36A4Q6YBV0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC36A4Q6YBV0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC36A4Q6YBV0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC36A4Q6YBV0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC36A4Q6YBV0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC36A4Q6YBV0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC36A4Q6YBV0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC36A4Q6YBV0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC36A4Q6YBV0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC36A4Q6YBV0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC36A4Q6YBV0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC36A4Q6YBV0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC36A4Q6YBV0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC36A4Q6YBV0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC36A4Q6YBV0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC36A4Q6YBV0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC36A4Q6YBV0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC36A4Q6YBV0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC36A4Q6YBV0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC36A4Q6YBV0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC36A4Q6YBV0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC36A4Q6YBV0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC36A4Q6YBV0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC36A4Q6YBV0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC36A4Q6YBV0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC36A4Q6YBV0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC36A4Q6YBV0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC36A4Q6YBV0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC36A4Q6YBV0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC36A4Q6YBV0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC36A4Q6YBV0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC36A4Q6YBV0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC36A4Q6YBV0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC36A4Q6YBV0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC36A4Q6YBV0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC36A4Q6YBV0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC36A4Q6YBV0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC36A4Q6YBV0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC36A4Q6YBV0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC36A4Q6YBV0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC36A4Q6YBV0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC36A4Q6YBV0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC36A4Q6YBV0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC36A4Q6YBV0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC36A4Q6YBV0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC36A4Q6YBV0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC36A4Q6YBV0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC36A4Q6YBV0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC36A4Q6YBV0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC36A4Q6YBV0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC36A4Q6YBV0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC36A4Q6YBV0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC36A4Q6YBV0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC36A4Q6YBV0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC36A4Q6YBV0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SLC36A4Q6YBV0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC36A4Q6YBV0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC36A4Q6YBV0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC36A4Q6YBV0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC36A4Q6YBV0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC36A4Q6YBV0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC36A4Q6YBV0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC36A4Q6YBV0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC36A4Q6YBV0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms