Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP12Q6UXS9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP12Q6UXS9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP12Q6UXS9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP12Q6UXS9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP12Q6UXS9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP12Q6UXS9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP12Q6UXS9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP12Q6UXS9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP12Q6UXS9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP12Q6UXS9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP12Q6UXS9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP12Q6UXS9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CASP12Q6UXS9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CASP12Q6UXS9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP12Q6UXS9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP12Q6UXS9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP12Q6UXS9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP12Q6UXS9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP12Q6UXS9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP12Q6UXS9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP12Q6UXS9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP12Q6UXS9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP12Q6UXS9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP12Q6UXS9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP12Q6UXS9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP12Q6UXS9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP12Q6UXS9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP12Q6UXS9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP12Q6UXS9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP12Q6UXS9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP12Q6UXS9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP12Q6UXS9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASP12Q6UXS9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP12Q6UXS9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP12Q6UXS9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP12Q6UXS9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP12Q6UXS9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP12Q6UXS9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP12Q6UXS9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP12Q6UXS9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP12Q6UXS9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP12Q6UXS9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP12Q6UXS9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP12Q6UXS9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP12Q6UXS9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP12Q6UXS9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP12Q6UXS9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP12Q6UXS9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP12Q6UXS9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP12Q6UXS9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP12Q6UXS9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP12Q6UXS9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP12Q6UXS9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP12Q6UXS9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP12Q6UXS9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP12Q6UXS9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP12Q6UXS9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP12Q6UXS9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP12Q6UXS9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP12Q6UXS9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP12Q6UXS9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP12Q6UXS9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP12Q6UXS9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP12Q6UXS9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP12Q6UXS9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP12Q6UXS9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP12Q6UXS9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP12Q6UXS9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP12Q6UXS9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP12Q6UXS9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP12Q6UXS9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP12Q6UXS9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP12Q6UXS9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP12Q6UXS9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP12Q6UXS9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP12Q6UXS9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP12Q6UXS9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP12Q6UXS9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP12Q6UXS9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP12Q6UXS9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP12Q6UXS9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP12Q6UXS9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP12Q6UXS9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP12Q6UXS9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP12Q6UXS9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP12Q6UXS9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP12Q6UXS9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP12Q6UXS9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP12Q6UXS9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP12Q6UXS9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP12Q6UXS9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP12Q6UXS9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP12Q6UXS9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP12Q6UXS9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP12Q6UXS9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP12Q6UXS9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP12Q6UXS9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP12Q6UXS9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP12Q6UXS9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms