Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXK5

LRRN1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN1Q6UXK5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRN1Q6UXK5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRN1Q6UXK5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRN1Q6UXK5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRN1Q6UXK5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRN1Q6UXK5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRN1Q6UXK5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRN1Q6UXK5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRN1Q6UXK5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRN1Q6UXK5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRN1Q6UXK5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRN1Q6UXK5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRN1Q6UXK5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRN1Q6UXK5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRN1Q6UXK5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRN1Q6UXK5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRN1Q6UXK5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRN1Q6UXK5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRN1Q6UXK5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRN1Q6UXK5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRN1Q6UXK5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRN1Q6UXK5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRN1Q6UXK5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRN1Q6UXK5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRN1Q6UXK5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN1Q6UXK5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN1Q6UXK5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN1Q6UXK5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRN1Q6UXK5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRN1Q6UXK5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRN1Q6UXK5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRN1Q6UXK5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRN1Q6UXK5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRN1Q6UXK5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRN1Q6UXK5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRN1Q6UXK5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRN1Q6UXK5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRN1Q6UXK5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRN1Q6UXK5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRN1Q6UXK5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRN1Q6UXK5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRN1Q6UXK5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRN1Q6UXK5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN1Q6UXK5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN1Q6UXK5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN1Q6UXK5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRN1Q6UXK5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRN1Q6UXK5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRN1Q6UXK5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRN1Q6UXK5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRN1Q6UXK5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRN1Q6UXK5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRN1Q6UXK5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRN1Q6UXK5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRN1Q6UXK5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRN1Q6UXK5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRN1Q6UXK5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRN1Q6UXK5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRN1Q6UXK5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRN1Q6UXK5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRN1Q6UXK5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRN1Q6UXK5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRN1Q6UXK5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRN1Q6UXK5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRN1Q6UXK5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRN1Q6UXK5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRN1Q6UXK5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRN1Q6UXK5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRN1Q6UXK5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRN1Q6UXK5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRN1Q6UXK5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRN1Q6UXK5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRN1Q6UXK5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRN1Q6UXK5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRN1Q6UXK5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRN1Q6UXK5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRN1Q6UXK5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRN1Q6UXK5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRN1Q6UXK5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRN1Q6UXK5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRN1Q6UXK5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRN1Q6UXK5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRN1Q6UXK5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRN1Q6UXK5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRN1Q6UXK5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRN1Q6UXK5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRN1Q6UXK5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRN1Q6UXK5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRN1Q6UXK5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRN1Q6UXK5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRN1Q6UXK5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRN1Q6UXK5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRN1Q6UXK5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRN1Q6UXK5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRN1Q6UXK5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRN1Q6UXK5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRN1Q6UXK5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRN1Q6UXK5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRN1Q6UXK5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRN1Q6UXK5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms