Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CXCL17Q6UXB2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CXCL17Q6UXB2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CXCL17Q6UXB2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CXCL17Q6UXB2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CXCL17Q6UXB2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CXCL17Q6UXB2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CXCL17Q6UXB2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CXCL17Q6UXB2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CXCL17Q6UXB2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CXCL17Q6UXB2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CXCL17Q6UXB2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CXCL17Q6UXB2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CXCL17Q6UXB2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CXCL17Q6UXB2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CXCL17Q6UXB2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CXCL17Q6UXB2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CXCL17Q6UXB2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CXCL17Q6UXB2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CXCL17Q6UXB2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CXCL17Q6UXB2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CXCL17Q6UXB2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CXCL17Q6UXB2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CXCL17Q6UXB2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CXCL17Q6UXB2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CXCL17Q6UXB2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CXCL17Q6UXB2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CXCL17Q6UXB2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CXCL17Q6UXB2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CXCL17Q6UXB2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CXCL17Q6UXB2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CXCL17Q6UXB2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CXCL17Q6UXB2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CXCL17Q6UXB2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CXCL17Q6UXB2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CXCL17Q6UXB2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CXCL17Q6UXB2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CXCL17Q6UXB2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CXCL17Q6UXB2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CXCL17Q6UXB2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CXCL17Q6UXB2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CXCL17Q6UXB2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CXCL17Q6UXB2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CXCL17Q6UXB2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CXCL17Q6UXB2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CXCL17Q6UXB2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CXCL17Q6UXB2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CXCL17Q6UXB2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CXCL17Q6UXB2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CXCL17Q6UXB2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CXCL17Q6UXB2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CXCL17Q6UXB2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CXCL17Q6UXB2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CXCL17Q6UXB2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CXCL17Q6UXB2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CXCL17Q6UXB2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CXCL17Q6UXB2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CXCL17Q6UXB2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CXCL17Q6UXB2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CXCL17Q6UXB2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CXCL17Q6UXB2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CXCL17Q6UXB2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CXCL17Q6UXB2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CXCL17Q6UXB2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CXCL17Q6UXB2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CXCL17Q6UXB2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CXCL17Q6UXB2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CXCL17Q6UXB2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CXCL17Q6UXB2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CXCL17Q6UXB2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CXCL17Q6UXB2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CXCL17Q6UXB2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CXCL17Q6UXB2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CXCL17Q6UXB2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CXCL17Q6UXB2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CXCL17Q6UXB2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CXCL17Q6UXB2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CXCL17Q6UXB2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CXCL17Q6UXB2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CXCL17Q6UXB2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CXCL17Q6UXB2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CXCL17Q6UXB2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CXCL17Q6UXB2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CXCL17Q6UXB2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CXCL17Q6UXB2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CXCL17Q6UXB2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CXCL17Q6UXB2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CXCL17Q6UXB2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CXCL17Q6UXB2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CXCL17Q6UXB2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CXCL17Q6UXB2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CXCL17Q6UXB2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CXCL17Q6UXB2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CXCL17Q6UXB2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CXCL17Q6UXB2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CXCL17Q6UXB2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CXCL17Q6UXB2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CXCL17Q6UXB2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CXCL17Q6UXB2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CXCL17Q6UXB2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms