Protein–RNA interactions for Protein: Q6UB28

METAP1D, Methionine aminopeptidase 1D, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
METAP1DQ6UB28 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
METAP1DQ6UB28 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
METAP1DQ6UB28 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
METAP1DQ6UB28 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
METAP1DQ6UB28 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
METAP1DQ6UB28 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
METAP1DQ6UB28 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
METAP1DQ6UB28 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
METAP1DQ6UB28 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
METAP1DQ6UB28 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
METAP1DQ6UB28 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
METAP1DQ6UB28 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
METAP1DQ6UB28 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
METAP1DQ6UB28 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
METAP1DQ6UB28 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
METAP1DQ6UB28 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
METAP1DQ6UB28 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
METAP1DQ6UB28 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
METAP1DQ6UB28 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
METAP1DQ6UB28 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
METAP1DQ6UB28 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
METAP1DQ6UB28 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
METAP1DQ6UB28 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
METAP1DQ6UB28 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
METAP1DQ6UB28 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
METAP1DQ6UB28 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
METAP1DQ6UB28 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
METAP1DQ6UB28 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
METAP1DQ6UB28 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
METAP1DQ6UB28 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
METAP1DQ6UB28 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
METAP1DQ6UB28 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
METAP1DQ6UB28 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
METAP1DQ6UB28 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
METAP1DQ6UB28 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
METAP1DQ6UB28 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
METAP1DQ6UB28 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
METAP1DQ6UB28 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
METAP1DQ6UB28 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
METAP1DQ6UB28 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
METAP1DQ6UB28 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
METAP1DQ6UB28 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
METAP1DQ6UB28 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
METAP1DQ6UB28 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
METAP1DQ6UB28 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
METAP1DQ6UB28 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
METAP1DQ6UB28 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
METAP1DQ6UB28 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
METAP1DQ6UB28 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
METAP1DQ6UB28 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
METAP1DQ6UB28 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
METAP1DQ6UB28 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
METAP1DQ6UB28 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
METAP1DQ6UB28 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
METAP1DQ6UB28 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
METAP1DQ6UB28 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
METAP1DQ6UB28 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
METAP1DQ6UB28 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
METAP1DQ6UB28 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
METAP1DQ6UB28 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
METAP1DQ6UB28 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
METAP1DQ6UB28 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
METAP1DQ6UB28 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
METAP1DQ6UB28 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
METAP1DQ6UB28 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
METAP1DQ6UB28 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
METAP1DQ6UB28 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
METAP1DQ6UB28 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
METAP1DQ6UB28 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
METAP1DQ6UB28 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
METAP1DQ6UB28 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
METAP1DQ6UB28 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
METAP1DQ6UB28 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
METAP1DQ6UB28 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
METAP1DQ6UB28 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
METAP1DQ6UB28 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
METAP1DQ6UB28 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
METAP1DQ6UB28 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
METAP1DQ6UB28 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
METAP1DQ6UB28 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
METAP1DQ6UB28 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
METAP1DQ6UB28 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
METAP1DQ6UB28 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
METAP1DQ6UB28 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
METAP1DQ6UB28 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
METAP1DQ6UB28 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
METAP1DQ6UB28 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
METAP1DQ6UB28 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
METAP1DQ6UB28 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
METAP1DQ6UB28 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
METAP1DQ6UB28 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
METAP1DQ6UB28 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
METAP1DQ6UB28 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
METAP1DQ6UB28 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
METAP1DQ6UB28 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
METAP1DQ6UB28 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
METAP1DQ6UB28 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
METAP1DQ6UB28 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
METAP1DQ6UB28 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
METAP1DQ6UB28 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms