Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJG6

BRAT1, BRCA1-associated ATM activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAT1Q6PJG6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRAT1Q6PJG6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRAT1Q6PJG6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRAT1Q6PJG6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRAT1Q6PJG6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRAT1Q6PJG6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRAT1Q6PJG6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRAT1Q6PJG6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRAT1Q6PJG6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRAT1Q6PJG6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRAT1Q6PJG6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRAT1Q6PJG6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRAT1Q6PJG6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRAT1Q6PJG6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRAT1Q6PJG6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRAT1Q6PJG6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRAT1Q6PJG6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRAT1Q6PJG6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
BRAT1Q6PJG6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRAT1Q6PJG6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRAT1Q6PJG6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRAT1Q6PJG6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRAT1Q6PJG6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRAT1Q6PJG6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRAT1Q6PJG6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRAT1Q6PJG6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRAT1Q6PJG6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRAT1Q6PJG6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRAT1Q6PJG6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRAT1Q6PJG6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRAT1Q6PJG6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRAT1Q6PJG6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRAT1Q6PJG6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRAT1Q6PJG6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRAT1Q6PJG6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRAT1Q6PJG6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRAT1Q6PJG6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRAT1Q6PJG6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRAT1Q6PJG6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRAT1Q6PJG6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRAT1Q6PJG6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRAT1Q6PJG6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRAT1Q6PJG6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRAT1Q6PJG6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRAT1Q6PJG6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRAT1Q6PJG6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRAT1Q6PJG6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRAT1Q6PJG6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRAT1Q6PJG6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRAT1Q6PJG6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRAT1Q6PJG6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRAT1Q6PJG6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRAT1Q6PJG6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRAT1Q6PJG6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRAT1Q6PJG6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRAT1Q6PJG6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRAT1Q6PJG6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRAT1Q6PJG6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRAT1Q6PJG6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRAT1Q6PJG6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRAT1Q6PJG6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRAT1Q6PJG6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BRAT1Q6PJG6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
BRAT1Q6PJG6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRAT1Q6PJG6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRAT1Q6PJG6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRAT1Q6PJG6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRAT1Q6PJG6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRAT1Q6PJG6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRAT1Q6PJG6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRAT1Q6PJG6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRAT1Q6PJG6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRAT1Q6PJG6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRAT1Q6PJG6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRAT1Q6PJG6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRAT1Q6PJG6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRAT1Q6PJG6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRAT1Q6PJG6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRAT1Q6PJG6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRAT1Q6PJG6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRAT1Q6PJG6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRAT1Q6PJG6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRAT1Q6PJG6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRAT1Q6PJG6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRAT1Q6PJG6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRAT1Q6PJG6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRAT1Q6PJG6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRAT1Q6PJG6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
BRAT1Q6PJG6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRAT1Q6PJG6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRAT1Q6PJG6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRAT1Q6PJG6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRAT1Q6PJG6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRAT1Q6PJG6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRAT1Q6PJG6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRAT1Q6PJG6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRAT1Q6PJG6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRAT1Q6PJG6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRAT1Q6PJG6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
BRAT1Q6PJG6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms