Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL35Q6PF15 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL35Q6PF15 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL35Q6PF15 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL35Q6PF15 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL35Q6PF15 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL35Q6PF15 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHL35Q6PF15 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHL35Q6PF15 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHL35Q6PF15 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHL35Q6PF15 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL35Q6PF15 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL35Q6PF15 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL35Q6PF15 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL35Q6PF15 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL35Q6PF15 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL35Q6PF15 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL35Q6PF15 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL35Q6PF15 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL35Q6PF15 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL35Q6PF15 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL35Q6PF15 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL35Q6PF15 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL35Q6PF15 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KLHL35Q6PF15 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL35Q6PF15 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL35Q6PF15 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL35Q6PF15 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL35Q6PF15 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL35Q6PF15 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHL35Q6PF15 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL35Q6PF15 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL35Q6PF15 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL35Q6PF15 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL35Q6PF15 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KLHL35Q6PF15 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL35Q6PF15 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL35Q6PF15 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL35Q6PF15 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL35Q6PF15 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL35Q6PF15 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL35Q6PF15 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL35Q6PF15 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLHL35Q6PF15 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLHL35Q6PF15 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KLHL35Q6PF15 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL35Q6PF15 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL35Q6PF15 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL35Q6PF15 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL35Q6PF15 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL35Q6PF15 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL35Q6PF15 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL35Q6PF15 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL35Q6PF15 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL35Q6PF15 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL35Q6PF15 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL35Q6PF15 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL35Q6PF15 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL35Q6PF15 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL35Q6PF15 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL35Q6PF15 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL35Q6PF15 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL35Q6PF15 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL35Q6PF15 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL35Q6PF15 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL35Q6PF15 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL35Q6PF15 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL35Q6PF15 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL35Q6PF15 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL35Q6PF15 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL35Q6PF15 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL35Q6PF15 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL35Q6PF15 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL35Q6PF15 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL35Q6PF15 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL35Q6PF15 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL35Q6PF15 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL35Q6PF15 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL35Q6PF15 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL35Q6PF15 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL35Q6PF15 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL35Q6PF15 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL35Q6PF15 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL35Q6PF15 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL35Q6PF15 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL35Q6PF15 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL35Q6PF15 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL35Q6PF15 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL35Q6PF15 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL35Q6PF15 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL35Q6PF15 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL35Q6PF15 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL35Q6PF15 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL35Q6PF15 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL35Q6PF15 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL35Q6PF15 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL35Q6PF15 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL35Q6PF15 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL35Q6PF15 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL35Q6PF15 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms