Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RFWD3Q6PCD5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RFWD3Q6PCD5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RFWD3Q6PCD5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RFWD3Q6PCD5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RFWD3Q6PCD5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RFWD3Q6PCD5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RFWD3Q6PCD5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RFWD3Q6PCD5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RFWD3Q6PCD5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RFWD3Q6PCD5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RFWD3Q6PCD5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RFWD3Q6PCD5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RFWD3Q6PCD5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RFWD3Q6PCD5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RFWD3Q6PCD5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RFWD3Q6PCD5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RFWD3Q6PCD5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RFWD3Q6PCD5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RFWD3Q6PCD5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RFWD3Q6PCD5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RFWD3Q6PCD5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RFWD3Q6PCD5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RFWD3Q6PCD5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RFWD3Q6PCD5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RFWD3Q6PCD5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RFWD3Q6PCD5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RFWD3Q6PCD5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RFWD3Q6PCD5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RFWD3Q6PCD5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFWD3Q6PCD5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RFWD3Q6PCD5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RFWD3Q6PCD5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RFWD3Q6PCD5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFWD3Q6PCD5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFWD3Q6PCD5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFWD3Q6PCD5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFWD3Q6PCD5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFWD3Q6PCD5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFWD3Q6PCD5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFWD3Q6PCD5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFWD3Q6PCD5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RFWD3Q6PCD5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RFWD3Q6PCD5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFWD3Q6PCD5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFWD3Q6PCD5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RFWD3Q6PCD5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RFWD3Q6PCD5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RFWD3Q6PCD5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RFWD3Q6PCD5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
RFWD3Q6PCD5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RFWD3Q6PCD5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RFWD3Q6PCD5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
RFWD3Q6PCD5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RFWD3Q6PCD5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RFWD3Q6PCD5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
RFWD3Q6PCD5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RFWD3Q6PCD5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RFWD3Q6PCD5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RFWD3Q6PCD5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RFWD3Q6PCD5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RFWD3Q6PCD5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RFWD3Q6PCD5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RFWD3Q6PCD5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RFWD3Q6PCD5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RFWD3Q6PCD5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RFWD3Q6PCD5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RFWD3Q6PCD5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RFWD3Q6PCD5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFWD3Q6PCD5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFWD3Q6PCD5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFWD3Q6PCD5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFWD3Q6PCD5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFWD3Q6PCD5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFWD3Q6PCD5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RFWD3Q6PCD5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RFWD3Q6PCD5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RFWD3Q6PCD5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RFWD3Q6PCD5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RFWD3Q6PCD5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RFWD3Q6PCD5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RFWD3Q6PCD5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFWD3Q6PCD5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFWD3Q6PCD5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFWD3Q6PCD5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFWD3Q6PCD5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFWD3Q6PCD5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RFWD3Q6PCD5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RFWD3Q6PCD5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RFWD3Q6PCD5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RFWD3Q6PCD5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFWD3Q6PCD5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFWD3Q6PCD5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFWD3Q6PCD5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFWD3Q6PCD5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFWD3Q6PCD5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFWD3Q6PCD5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFWD3Q6PCD5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFWD3Q6PCD5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFWD3Q6PCD5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms