Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4A7

SFXN4, Sideroflexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4Q6P4A7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFXN4Q6P4A7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFXN4Q6P4A7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFXN4Q6P4A7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFXN4Q6P4A7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFXN4Q6P4A7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFXN4Q6P4A7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFXN4Q6P4A7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFXN4Q6P4A7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFXN4Q6P4A7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFXN4Q6P4A7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFXN4Q6P4A7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFXN4Q6P4A7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFXN4Q6P4A7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFXN4Q6P4A7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFXN4Q6P4A7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFXN4Q6P4A7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFXN4Q6P4A7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFXN4Q6P4A7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFXN4Q6P4A7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFXN4Q6P4A7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFXN4Q6P4A7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFXN4Q6P4A7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFXN4Q6P4A7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFXN4Q6P4A7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFXN4Q6P4A7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFXN4Q6P4A7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFXN4Q6P4A7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SFXN4Q6P4A7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFXN4Q6P4A7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFXN4Q6P4A7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFXN4Q6P4A7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFXN4Q6P4A7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFXN4Q6P4A7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFXN4Q6P4A7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFXN4Q6P4A7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFXN4Q6P4A7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFXN4Q6P4A7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFXN4Q6P4A7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFXN4Q6P4A7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFXN4Q6P4A7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFXN4Q6P4A7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFXN4Q6P4A7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFXN4Q6P4A7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SFXN4Q6P4A7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SFXN4Q6P4A7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFXN4Q6P4A7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFXN4Q6P4A7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFXN4Q6P4A7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFXN4Q6P4A7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFXN4Q6P4A7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFXN4Q6P4A7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFXN4Q6P4A7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFXN4Q6P4A7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFXN4Q6P4A7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFXN4Q6P4A7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SFXN4Q6P4A7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFXN4Q6P4A7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFXN4Q6P4A7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFXN4Q6P4A7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFXN4Q6P4A7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFXN4Q6P4A7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFXN4Q6P4A7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFXN4Q6P4A7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFXN4Q6P4A7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFXN4Q6P4A7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFXN4Q6P4A7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFXN4Q6P4A7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFXN4Q6P4A7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFXN4Q6P4A7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFXN4Q6P4A7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SFXN4Q6P4A7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SFXN4Q6P4A7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFXN4Q6P4A7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFXN4Q6P4A7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFXN4Q6P4A7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SFXN4Q6P4A7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFXN4Q6P4A7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFXN4Q6P4A7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFXN4Q6P4A7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFXN4Q6P4A7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SFXN4Q6P4A7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFXN4Q6P4A7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFXN4Q6P4A7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFXN4Q6P4A7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFXN4Q6P4A7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFXN4Q6P4A7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFXN4Q6P4A7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFXN4Q6P4A7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFXN4Q6P4A7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFXN4Q6P4A7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFXN4Q6P4A7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFXN4Q6P4A7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFXN4Q6P4A7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFXN4Q6P4A7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFXN4Q6P4A7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFXN4Q6P4A7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFXN4Q6P4A7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFXN4Q6P4A7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFXN4Q6P4A7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms