Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1R3

MSANTD2, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD2Q6P1R3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MSANTD2Q6P1R3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSANTD2Q6P1R3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSANTD2Q6P1R3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSANTD2Q6P1R3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSANTD2Q6P1R3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSANTD2Q6P1R3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSANTD2Q6P1R3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MSANTD2Q6P1R3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
MSANTD2Q6P1R3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MSANTD2Q6P1R3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MSANTD2Q6P1R3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MSANTD2Q6P1R3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MSANTD2Q6P1R3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MSANTD2Q6P1R3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MSANTD2Q6P1R3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MSANTD2Q6P1R3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MSANTD2Q6P1R3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MSANTD2Q6P1R3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MSANTD2Q6P1R3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MSANTD2Q6P1R3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
MSANTD2Q6P1R3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MSANTD2Q6P1R3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MSANTD2Q6P1R3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MSANTD2Q6P1R3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MSANTD2Q6P1R3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MSANTD2Q6P1R3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MSANTD2Q6P1R3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MSANTD2Q6P1R3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MSANTD2Q6P1R3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSANTD2Q6P1R3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSANTD2Q6P1R3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSANTD2Q6P1R3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSANTD2Q6P1R3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSANTD2Q6P1R3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSANTD2Q6P1R3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MSANTD2Q6P1R3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MSANTD2Q6P1R3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MSANTD2Q6P1R3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MSANTD2Q6P1R3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MSANTD2Q6P1R3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MSANTD2Q6P1R3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MSANTD2Q6P1R3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MSANTD2Q6P1R3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MSANTD2Q6P1R3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MSANTD2Q6P1R3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MSANTD2Q6P1R3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MSANTD2Q6P1R3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MSANTD2Q6P1R3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MSANTD2Q6P1R3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MSANTD2Q6P1R3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MSANTD2Q6P1R3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MSANTD2Q6P1R3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MSANTD2Q6P1R3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MSANTD2Q6P1R3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MSANTD2Q6P1R3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MSANTD2Q6P1R3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MSANTD2Q6P1R3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MSANTD2Q6P1R3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MSANTD2Q6P1R3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MSANTD2Q6P1R3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MSANTD2Q6P1R3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MSANTD2Q6P1R3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MSANTD2Q6P1R3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSANTD2Q6P1R3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MSANTD2Q6P1R3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MSANTD2Q6P1R3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MSANTD2Q6P1R3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
MSANTD2Q6P1R3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MSANTD2Q6P1R3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MSANTD2Q6P1R3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MSANTD2Q6P1R3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MSANTD2Q6P1R3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MSANTD2Q6P1R3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MSANTD2Q6P1R3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MSANTD2Q6P1R3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MSANTD2Q6P1R3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MSANTD2Q6P1R3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MSANTD2Q6P1R3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MSANTD2Q6P1R3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MSANTD2Q6P1R3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MSANTD2Q6P1R3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MSANTD2Q6P1R3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MSANTD2Q6P1R3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MSANTD2Q6P1R3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MSANTD2Q6P1R3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MSANTD2Q6P1R3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MSANTD2Q6P1R3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MSANTD2Q6P1R3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MSANTD2Q6P1R3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MSANTD2Q6P1R3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MSANTD2Q6P1R3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MSANTD2Q6P1R3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MSANTD2Q6P1R3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MSANTD2Q6P1R3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MSANTD2Q6P1R3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MSANTD2Q6P1R3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MSANTD2Q6P1R3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MSANTD2Q6P1R3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MSANTD2Q6P1R3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms