Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M3

LLGL2, Lethal(2) giant larvae protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2Q6P1M3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LLGL2Q6P1M3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LLGL2Q6P1M3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LLGL2Q6P1M3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LLGL2Q6P1M3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LLGL2Q6P1M3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LLGL2Q6P1M3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LLGL2Q6P1M3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LLGL2Q6P1M3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LLGL2Q6P1M3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LLGL2Q6P1M3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LLGL2Q6P1M3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LLGL2Q6P1M3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LLGL2Q6P1M3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LLGL2Q6P1M3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LLGL2Q6P1M3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LLGL2Q6P1M3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LLGL2Q6P1M3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LLGL2Q6P1M3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LLGL2Q6P1M3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LLGL2Q6P1M3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LLGL2Q6P1M3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LLGL2Q6P1M3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LLGL2Q6P1M3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LLGL2Q6P1M3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LLGL2Q6P1M3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LLGL2Q6P1M3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LLGL2Q6P1M3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LLGL2Q6P1M3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LLGL2Q6P1M3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LLGL2Q6P1M3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LLGL2Q6P1M3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LLGL2Q6P1M3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LLGL2Q6P1M3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LLGL2Q6P1M3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LLGL2Q6P1M3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LLGL2Q6P1M3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LLGL2Q6P1M3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LLGL2Q6P1M3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LLGL2Q6P1M3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LLGL2Q6P1M3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LLGL2Q6P1M3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LLGL2Q6P1M3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LLGL2Q6P1M3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LLGL2Q6P1M3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LLGL2Q6P1M3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LLGL2Q6P1M3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LLGL2Q6P1M3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LLGL2Q6P1M3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LLGL2Q6P1M3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LLGL2Q6P1M3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
LLGL2Q6P1M3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LLGL2Q6P1M3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LLGL2Q6P1M3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LLGL2Q6P1M3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LLGL2Q6P1M3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LLGL2Q6P1M3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LLGL2Q6P1M3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LLGL2Q6P1M3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LLGL2Q6P1M3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LLGL2Q6P1M3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LLGL2Q6P1M3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LLGL2Q6P1M3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LLGL2Q6P1M3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LLGL2Q6P1M3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LLGL2Q6P1M3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LLGL2Q6P1M3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LLGL2Q6P1M3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LLGL2Q6P1M3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LLGL2Q6P1M3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LLGL2Q6P1M3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LLGL2Q6P1M3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LLGL2Q6P1M3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LLGL2Q6P1M3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LLGL2Q6P1M3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LLGL2Q6P1M3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LLGL2Q6P1M3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LLGL2Q6P1M3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LLGL2Q6P1M3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LLGL2Q6P1M3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
LLGL2Q6P1M3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LLGL2Q6P1M3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LLGL2Q6P1M3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LLGL2Q6P1M3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LLGL2Q6P1M3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LLGL2Q6P1M3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LLGL2Q6P1M3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LLGL2Q6P1M3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LLGL2Q6P1M3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LLGL2Q6P1M3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LLGL2Q6P1M3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LLGL2Q6P1M3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LLGL2Q6P1M3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LLGL2Q6P1M3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LLGL2Q6P1M3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LLGL2Q6P1M3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LLGL2Q6P1M3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LLGL2Q6P1M3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LLGL2Q6P1M3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LLGL2Q6P1M3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms