Protein–RNA interactions for Protein: Q6GPI1

CTRB2, Chymotrypsinogen B2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB2Q6GPI1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTRB2Q6GPI1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTRB2Q6GPI1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTRB2Q6GPI1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTRB2Q6GPI1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTRB2Q6GPI1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTRB2Q6GPI1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTRB2Q6GPI1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTRB2Q6GPI1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTRB2Q6GPI1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTRB2Q6GPI1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTRB2Q6GPI1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTRB2Q6GPI1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTRB2Q6GPI1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTRB2Q6GPI1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTRB2Q6GPI1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTRB2Q6GPI1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTRB2Q6GPI1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTRB2Q6GPI1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTRB2Q6GPI1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTRB2Q6GPI1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTRB2Q6GPI1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTRB2Q6GPI1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTRB2Q6GPI1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTRB2Q6GPI1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTRB2Q6GPI1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTRB2Q6GPI1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTRB2Q6GPI1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTRB2Q6GPI1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTRB2Q6GPI1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTRB2Q6GPI1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTRB2Q6GPI1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTRB2Q6GPI1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTRB2Q6GPI1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTRB2Q6GPI1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTRB2Q6GPI1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTRB2Q6GPI1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTRB2Q6GPI1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTRB2Q6GPI1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CTRB2Q6GPI1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTRB2Q6GPI1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTRB2Q6GPI1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTRB2Q6GPI1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTRB2Q6GPI1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTRB2Q6GPI1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTRB2Q6GPI1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTRB2Q6GPI1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTRB2Q6GPI1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTRB2Q6GPI1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTRB2Q6GPI1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTRB2Q6GPI1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTRB2Q6GPI1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTRB2Q6GPI1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTRB2Q6GPI1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTRB2Q6GPI1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTRB2Q6GPI1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTRB2Q6GPI1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTRB2Q6GPI1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTRB2Q6GPI1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTRB2Q6GPI1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CTRB2Q6GPI1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTRB2Q6GPI1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTRB2Q6GPI1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTRB2Q6GPI1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTRB2Q6GPI1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTRB2Q6GPI1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTRB2Q6GPI1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTRB2Q6GPI1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTRB2Q6GPI1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTRB2Q6GPI1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTRB2Q6GPI1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTRB2Q6GPI1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTRB2Q6GPI1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTRB2Q6GPI1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTRB2Q6GPI1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTRB2Q6GPI1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTRB2Q6GPI1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTRB2Q6GPI1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTRB2Q6GPI1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTRB2Q6GPI1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTRB2Q6GPI1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTRB2Q6GPI1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTRB2Q6GPI1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTRB2Q6GPI1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTRB2Q6GPI1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTRB2Q6GPI1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTRB2Q6GPI1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTRB2Q6GPI1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTRB2Q6GPI1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTRB2Q6GPI1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTRB2Q6GPI1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTRB2Q6GPI1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTRB2Q6GPI1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTRB2Q6GPI1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTRB2Q6GPI1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTRB2Q6GPI1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTRB2Q6GPI1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTRB2Q6GPI1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTRB2Q6GPI1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CTRB2Q6GPI1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms