Protein–RNA interactions for Protein: Q6FI13

HIST2H2AA3, Histone H2A type 2-A, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2AA3Q6FI13 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIST2H2AA3Q6FI13 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIST2H2AA3Q6FI13 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIST2H2AA3Q6FI13 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HIST2H2AA3Q6FI13 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIST2H2AA3Q6FI13 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIST2H2AA3Q6FI13 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIST2H2AA3Q6FI13 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIST2H2AA3Q6FI13 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIST2H2AA3Q6FI13 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIST2H2AA3Q6FI13 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIST2H2AA3Q6FI13 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIST2H2AA3Q6FI13 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIST2H2AA3Q6FI13 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIST2H2AA3Q6FI13 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HIST2H2AA3Q6FI13 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIST2H2AA3Q6FI13 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIST2H2AA3Q6FI13 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIST2H2AA3Q6FI13 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIST2H2AA3Q6FI13 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIST2H2AA3Q6FI13 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIST2H2AA3Q6FI13 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIST2H2AA3Q6FI13 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIST2H2AA3Q6FI13 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIST2H2AA3Q6FI13 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIST2H2AA3Q6FI13 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIST2H2AA3Q6FI13 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIST2H2AA3Q6FI13 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIST2H2AA3Q6FI13 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIST2H2AA3Q6FI13 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIST2H2AA3Q6FI13 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
HIST2H2AA3Q6FI13 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HIST2H2AA3Q6FI13 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIST2H2AA3Q6FI13 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIST2H2AA3Q6FI13 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIST2H2AA3Q6FI13 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIST2H2AA3Q6FI13 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HIST2H2AA3Q6FI13 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIST2H2AA3Q6FI13 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIST2H2AA3Q6FI13 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIST2H2AA3Q6FI13 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIST2H2AA3Q6FI13 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIST2H2AA3Q6FI13 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIST2H2AA3Q6FI13 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIST2H2AA3Q6FI13 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIST2H2AA3Q6FI13 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIST2H2AA3Q6FI13 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HIST2H2AA3Q6FI13 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIST2H2AA3Q6FI13 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIST2H2AA3Q6FI13 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIST2H2AA3Q6FI13 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIST2H2AA3Q6FI13 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIST2H2AA3Q6FI13 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIST2H2AA3Q6FI13 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIST2H2AA3Q6FI13 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIST2H2AA3Q6FI13 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIST2H2AA3Q6FI13 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIST2H2AA3Q6FI13 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIST2H2AA3Q6FI13 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIST2H2AA3Q6FI13 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIST2H2AA3Q6FI13 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIST2H2AA3Q6FI13 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIST2H2AA3Q6FI13 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIST2H2AA3Q6FI13 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIST2H2AA3Q6FI13 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIST2H2AA3Q6FI13 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIST2H2AA3Q6FI13 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIST2H2AA3Q6FI13 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIST2H2AA3Q6FI13 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIST2H2AA3Q6FI13 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIST2H2AA3Q6FI13 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIST2H2AA3Q6FI13 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIST2H2AA3Q6FI13 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIST2H2AA3Q6FI13 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIST2H2AA3Q6FI13 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIST2H2AA3Q6FI13 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIST2H2AA3Q6FI13 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIST2H2AA3Q6FI13 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIST2H2AA3Q6FI13 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIST2H2AA3Q6FI13 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIST2H2AA3Q6FI13 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HIST2H2AA3Q6FI13 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIST2H2AA3Q6FI13 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIST2H2AA3Q6FI13 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIST2H2AA3Q6FI13 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIST2H2AA3Q6FI13 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HIST2H2AA3Q6FI13 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIST2H2AA3Q6FI13 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HIST2H2AA3Q6FI13 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIST2H2AA3Q6FI13 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIST2H2AA3Q6FI13 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIST2H2AA3Q6FI13 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIST2H2AA3Q6FI13 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIST2H2AA3Q6FI13 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIST2H2AA3Q6FI13 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIST2H2AA3Q6FI13 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIST2H2AA3Q6FI13 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIST2H2AA3Q6FI13 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIST2H2AA3Q6FI13 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIST2H2AA3Q6FI13 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms