Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALS2CLQ60I27 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALS2CLQ60I27 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALS2CLQ60I27 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALS2CLQ60I27 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALS2CLQ60I27 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALS2CLQ60I27 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALS2CLQ60I27 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALS2CLQ60I27 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALS2CLQ60I27 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALS2CLQ60I27 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALS2CLQ60I27 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALS2CLQ60I27 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALS2CLQ60I27 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALS2CLQ60I27 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALS2CLQ60I27 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALS2CLQ60I27 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALS2CLQ60I27 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALS2CLQ60I27 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALS2CLQ60I27 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALS2CLQ60I27 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALS2CLQ60I27 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALS2CLQ60I27 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALS2CLQ60I27 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALS2CLQ60I27 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ALS2CLQ60I27 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ALS2CLQ60I27 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALS2CLQ60I27 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALS2CLQ60I27 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALS2CLQ60I27 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALS2CLQ60I27 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALS2CLQ60I27 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALS2CLQ60I27 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALS2CLQ60I27 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALS2CLQ60I27 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALS2CLQ60I27 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALS2CLQ60I27 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ALS2CLQ60I27 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALS2CLQ60I27 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALS2CLQ60I27 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALS2CLQ60I27 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALS2CLQ60I27 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALS2CLQ60I27 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALS2CLQ60I27 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALS2CLQ60I27 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALS2CLQ60I27 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ALS2CLQ60I27 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALS2CLQ60I27 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALS2CLQ60I27 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALS2CLQ60I27 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALS2CLQ60I27 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALS2CLQ60I27 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALS2CLQ60I27 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALS2CLQ60I27 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALS2CLQ60I27 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALS2CLQ60I27 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALS2CLQ60I27 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ALS2CLQ60I27 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
ALS2CLQ60I27 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ALS2CLQ60I27 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
ALS2CLQ60I27 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALS2CLQ60I27 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALS2CLQ60I27 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ALS2CLQ60I27 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ALS2CLQ60I27 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ALS2CLQ60I27 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ALS2CLQ60I27 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ALS2CLQ60I27 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ALS2CLQ60I27 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ALS2CLQ60I27 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALS2CLQ60I27 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALS2CLQ60I27 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ALS2CLQ60I27 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALS2CLQ60I27 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALS2CLQ60I27 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALS2CLQ60I27 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALS2CLQ60I27 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALS2CLQ60I27 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALS2CLQ60I27 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALS2CLQ60I27 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALS2CLQ60I27 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALS2CLQ60I27 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ALS2CLQ60I27 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALS2CLQ60I27 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALS2CLQ60I27 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALS2CLQ60I27 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALS2CLQ60I27 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALS2CLQ60I27 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALS2CLQ60I27 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALS2CLQ60I27 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALS2CLQ60I27 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALS2CLQ60I27 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALS2CLQ60I27 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALS2CLQ60I27 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALS2CLQ60I27 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALS2CLQ60I27 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALS2CLQ60I27 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALS2CLQ60I27 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALS2CLQ60I27 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALS2CLQ60I27 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms