Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIE3

VWA5B1, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B1, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B1Q5TIE3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VWA5B1Q5TIE3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VWA5B1Q5TIE3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VWA5B1Q5TIE3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VWA5B1Q5TIE3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VWA5B1Q5TIE3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VWA5B1Q5TIE3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VWA5B1Q5TIE3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VWA5B1Q5TIE3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VWA5B1Q5TIE3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VWA5B1Q5TIE3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VWA5B1Q5TIE3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VWA5B1Q5TIE3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VWA5B1Q5TIE3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VWA5B1Q5TIE3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VWA5B1Q5TIE3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
VWA5B1Q5TIE3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VWA5B1Q5TIE3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VWA5B1Q5TIE3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA5B1Q5TIE3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA5B1Q5TIE3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VWA5B1Q5TIE3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VWA5B1Q5TIE3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VWA5B1Q5TIE3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VWA5B1Q5TIE3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VWA5B1Q5TIE3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VWA5B1Q5TIE3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VWA5B1Q5TIE3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VWA5B1Q5TIE3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
VWA5B1Q5TIE3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VWA5B1Q5TIE3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VWA5B1Q5TIE3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VWA5B1Q5TIE3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VWA5B1Q5TIE3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VWA5B1Q5TIE3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VWA5B1Q5TIE3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VWA5B1Q5TIE3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VWA5B1Q5TIE3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VWA5B1Q5TIE3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VWA5B1Q5TIE3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VWA5B1Q5TIE3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VWA5B1Q5TIE3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VWA5B1Q5TIE3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VWA5B1Q5TIE3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VWA5B1Q5TIE3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VWA5B1Q5TIE3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VWA5B1Q5TIE3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VWA5B1Q5TIE3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VWA5B1Q5TIE3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VWA5B1Q5TIE3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VWA5B1Q5TIE3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VWA5B1Q5TIE3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VWA5B1Q5TIE3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VWA5B1Q5TIE3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VWA5B1Q5TIE3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VWA5B1Q5TIE3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VWA5B1Q5TIE3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VWA5B1Q5TIE3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VWA5B1Q5TIE3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VWA5B1Q5TIE3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VWA5B1Q5TIE3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VWA5B1Q5TIE3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VWA5B1Q5TIE3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VWA5B1Q5TIE3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VWA5B1Q5TIE3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VWA5B1Q5TIE3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VWA5B1Q5TIE3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VWA5B1Q5TIE3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VWA5B1Q5TIE3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VWA5B1Q5TIE3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VWA5B1Q5TIE3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VWA5B1Q5TIE3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VWA5B1Q5TIE3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VWA5B1Q5TIE3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VWA5B1Q5TIE3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VWA5B1Q5TIE3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VWA5B1Q5TIE3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VWA5B1Q5TIE3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VWA5B1Q5TIE3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VWA5B1Q5TIE3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VWA5B1Q5TIE3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VWA5B1Q5TIE3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
VWA5B1Q5TIE3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VWA5B1Q5TIE3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VWA5B1Q5TIE3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VWA5B1Q5TIE3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VWA5B1Q5TIE3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VWA5B1Q5TIE3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VWA5B1Q5TIE3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VWA5B1Q5TIE3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VWA5B1Q5TIE3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VWA5B1Q5TIE3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VWA5B1Q5TIE3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VWA5B1Q5TIE3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VWA5B1Q5TIE3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VWA5B1Q5TIE3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VWA5B1Q5TIE3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VWA5B1Q5TIE3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VWA5B1Q5TIE3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VWA5B1Q5TIE3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms