Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAMD5Q5TGI4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAMD5Q5TGI4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAMD5Q5TGI4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAMD5Q5TGI4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMD5Q5TGI4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMD5Q5TGI4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMD5Q5TGI4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMD5Q5TGI4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMD5Q5TGI4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMD5Q5TGI4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD5Q5TGI4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD5Q5TGI4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD5Q5TGI4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD5Q5TGI4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD5Q5TGI4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD5Q5TGI4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMD5Q5TGI4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMD5Q5TGI4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMD5Q5TGI4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMD5Q5TGI4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMD5Q5TGI4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMD5Q5TGI4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMD5Q5TGI4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMD5Q5TGI4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMD5Q5TGI4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMD5Q5TGI4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMD5Q5TGI4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD5Q5TGI4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD5Q5TGI4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD5Q5TGI4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD5Q5TGI4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD5Q5TGI4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMD5Q5TGI4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMD5Q5TGI4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMD5Q5TGI4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMD5Q5TGI4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMD5Q5TGI4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMD5Q5TGI4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMD5Q5TGI4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMD5Q5TGI4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMD5Q5TGI4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMD5Q5TGI4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMD5Q5TGI4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMD5Q5TGI4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMD5Q5TGI4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMD5Q5TGI4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMD5Q5TGI4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMD5Q5TGI4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMD5Q5TGI4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMD5Q5TGI4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMD5Q5TGI4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMD5Q5TGI4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMD5Q5TGI4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMD5Q5TGI4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMD5Q5TGI4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMD5Q5TGI4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD5Q5TGI4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD5Q5TGI4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD5Q5TGI4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD5Q5TGI4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD5Q5TGI4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD5Q5TGI4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD5Q5TGI4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD5Q5TGI4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD5Q5TGI4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD5Q5TGI4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD5Q5TGI4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD5Q5TGI4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD5Q5TGI4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD5Q5TGI4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD5Q5TGI4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD5Q5TGI4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD5Q5TGI4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD5Q5TGI4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAMD5Q5TGI4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAMD5Q5TGI4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SAMD5Q5TGI4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD5Q5TGI4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD5Q5TGI4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD5Q5TGI4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD5Q5TGI4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD5Q5TGI4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD5Q5TGI4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMD5Q5TGI4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMD5Q5TGI4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMD5Q5TGI4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMD5Q5TGI4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAMD5Q5TGI4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAMD5Q5TGI4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAMD5Q5TGI4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAMD5Q5TGI4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAMD5Q5TGI4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAMD5Q5TGI4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAMD5Q5TGI4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAMD5Q5TGI4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAMD5Q5TGI4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAMD5Q5TGI4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAMD5Q5TGI4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAMD5Q5TGI4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms