Protein–RNA interactions for Protein: Q5TEC6

HIST2H3PS2, Histone H3, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H3PS2Q5TEC6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HIST2H3PS2Q5TEC6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIST2H3PS2Q5TEC6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HIST2H3PS2Q5TEC6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIST2H3PS2Q5TEC6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HIST2H3PS2Q5TEC6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIST2H3PS2Q5TEC6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HIST2H3PS2Q5TEC6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIST2H3PS2Q5TEC6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIST2H3PS2Q5TEC6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HIST2H3PS2Q5TEC6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIST2H3PS2Q5TEC6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIST2H3PS2Q5TEC6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIST2H3PS2Q5TEC6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIST2H3PS2Q5TEC6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIST2H3PS2Q5TEC6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HIST2H3PS2Q5TEC6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIST2H3PS2Q5TEC6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIST2H3PS2Q5TEC6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIST2H3PS2Q5TEC6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HIST2H3PS2Q5TEC6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIST2H3PS2Q5TEC6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIST2H3PS2Q5TEC6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIST2H3PS2Q5TEC6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIST2H3PS2Q5TEC6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIST2H3PS2Q5TEC6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIST2H3PS2Q5TEC6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIST2H3PS2Q5TEC6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIST2H3PS2Q5TEC6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIST2H3PS2Q5TEC6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIST2H3PS2Q5TEC6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIST2H3PS2Q5TEC6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIST2H3PS2Q5TEC6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIST2H3PS2Q5TEC6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIST2H3PS2Q5TEC6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIST2H3PS2Q5TEC6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIST2H3PS2Q5TEC6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIST2H3PS2Q5TEC6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIST2H3PS2Q5TEC6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIST2H3PS2Q5TEC6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIST2H3PS2Q5TEC6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIST2H3PS2Q5TEC6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIST2H3PS2Q5TEC6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIST2H3PS2Q5TEC6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIST2H3PS2Q5TEC6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIST2H3PS2Q5TEC6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIST2H3PS2Q5TEC6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIST2H3PS2Q5TEC6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIST2H3PS2Q5TEC6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIST2H3PS2Q5TEC6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIST2H3PS2Q5TEC6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIST2H3PS2Q5TEC6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIST2H3PS2Q5TEC6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIST2H3PS2Q5TEC6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIST2H3PS2Q5TEC6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIST2H3PS2Q5TEC6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIST2H3PS2Q5TEC6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIST2H3PS2Q5TEC6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIST2H3PS2Q5TEC6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIST2H3PS2Q5TEC6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIST2H3PS2Q5TEC6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIST2H3PS2Q5TEC6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIST2H3PS2Q5TEC6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIST2H3PS2Q5TEC6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIST2H3PS2Q5TEC6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIST2H3PS2Q5TEC6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIST2H3PS2Q5TEC6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIST2H3PS2Q5TEC6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIST2H3PS2Q5TEC6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIST2H3PS2Q5TEC6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HIST2H3PS2Q5TEC6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HIST2H3PS2Q5TEC6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIST2H3PS2Q5TEC6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIST2H3PS2Q5TEC6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIST2H3PS2Q5TEC6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIST2H3PS2Q5TEC6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIST2H3PS2Q5TEC6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIST2H3PS2Q5TEC6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIST2H3PS2Q5TEC6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIST2H3PS2Q5TEC6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIST2H3PS2Q5TEC6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIST2H3PS2Q5TEC6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIST2H3PS2Q5TEC6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIST2H3PS2Q5TEC6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIST2H3PS2Q5TEC6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIST2H3PS2Q5TEC6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIST2H3PS2Q5TEC6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIST2H3PS2Q5TEC6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIST2H3PS2Q5TEC6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIST2H3PS2Q5TEC6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIST2H3PS2Q5TEC6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIST2H3PS2Q5TEC6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIST2H3PS2Q5TEC6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIST2H3PS2Q5TEC6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIST2H3PS2Q5TEC6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
HIST2H3PS2Q5TEC6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIST2H3PS2Q5TEC6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIST2H3PS2Q5TEC6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIST2H3PS2Q5TEC6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIST2H3PS2Q5TEC6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms