Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5M9

CCNJ, Cyclin-J, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNJQ5T5M9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNJQ5T5M9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNJQ5T5M9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNJQ5T5M9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNJQ5T5M9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNJQ5T5M9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNJQ5T5M9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNJQ5T5M9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNJQ5T5M9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNJQ5T5M9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNJQ5T5M9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNJQ5T5M9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNJQ5T5M9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNJQ5T5M9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNJQ5T5M9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCNJQ5T5M9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNJQ5T5M9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNJQ5T5M9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNJQ5T5M9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNJQ5T5M9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNJQ5T5M9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNJQ5T5M9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNJQ5T5M9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNJQ5T5M9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNJQ5T5M9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNJQ5T5M9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNJQ5T5M9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNJQ5T5M9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNJQ5T5M9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNJQ5T5M9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNJQ5T5M9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNJQ5T5M9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNJQ5T5M9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNJQ5T5M9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNJQ5T5M9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNJQ5T5M9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNJQ5T5M9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNJQ5T5M9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNJQ5T5M9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNJQ5T5M9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNJQ5T5M9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNJQ5T5M9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNJQ5T5M9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNJQ5T5M9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNJQ5T5M9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNJQ5T5M9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNJQ5T5M9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNJQ5T5M9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNJQ5T5M9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNJQ5T5M9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNJQ5T5M9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNJQ5T5M9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNJQ5T5M9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNJQ5T5M9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNJQ5T5M9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNJQ5T5M9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNJQ5T5M9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNJQ5T5M9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNJQ5T5M9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNJQ5T5M9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNJQ5T5M9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNJQ5T5M9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNJQ5T5M9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNJQ5T5M9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNJQ5T5M9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNJQ5T5M9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNJQ5T5M9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNJQ5T5M9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNJQ5T5M9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNJQ5T5M9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNJQ5T5M9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNJQ5T5M9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNJQ5T5M9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNJQ5T5M9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNJQ5T5M9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNJQ5T5M9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNJQ5T5M9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNJQ5T5M9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNJQ5T5M9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNJQ5T5M9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNJQ5T5M9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNJQ5T5M9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNJQ5T5M9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNJQ5T5M9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNJQ5T5M9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNJQ5T5M9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNJQ5T5M9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNJQ5T5M9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNJQ5T5M9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNJQ5T5M9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNJQ5T5M9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNJQ5T5M9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNJQ5T5M9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNJQ5T5M9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNJQ5T5M9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNJQ5T5M9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNJQ5T5M9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNJQ5T5M9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNJQ5T5M9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNJQ5T5M9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
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